图书介绍
表观遗传学与精准医学pdf电子书版本下载
- 朱景德等著 著
- 出版社： 上海：上海交通大学出版社
- ISBN：9787313184115
- 出版时间：2017
- 标注页数：456页
- 文件大小：164MB
- 文件页数：486页
- 主题词：表观遗传学－应用－医学
PDF下载
下载说明
表观遗传学与精准医学PDF格式电子书版下载
下载的文件为RAR压缩包。需要使用解压软件进行解压得到PDF格式图书。建议使用BT下载工具Free Download Manager进行下载,简称FDM(免费,没有广告,支持多平台）。本站资源全部打包为BT种子。所以需要使用专业的BT下载软件进行下载。如 BitComet qBittorrent uTorrent等BT下载工具。迅雷目前由于本站不是热门资源。不推荐使用！后期资源热门了。安装了迅雷也可以迅雷进行下载！
（文件页数 要大于 标注页数，上中下等多册电子书除外）
注意：本站所有压缩包均有解压码： 点击下载压缩包解压工具
图书目录
1 正常和疾病状态下的表观基因组学系统研究 1
1.1 表观遗传实验方法 2
1.1.1 DNA甲基化的研究方法 3
1.1.2 组蛋白修饰及DNA结合蛋白的研究方法 6
1.1.3 染色质可接近性的研究方法 8
1.1.4 染色质构象的研究方法 10
1.2 表观遗传组学数据的系统分析 13
1.2.1 组蛋白修饰 13
1.2.2 DNA甲基化 16
1.2.3 染色质开放性检测的高通量数据分析 18
1.2.4 基因组三维结构研究 21
1.2.5 表观基因组预测：通过DNA序列推测表观遗传状态 22
1.2.6 表观遗传数据库 23
1.2.7 国内表观遗传组学技术研究进展 24
1.3 表观遗传组学国际合作研究计划 25
1.3.1 DNA元件百科全书计划 26
1.3.2 美国国立卫生研究院的表观基因组路线图计划 27
1.3.3 欧盟的表观遗传学计划 28
1.3.4 国际人类表观基因组联盟科研合作蓝图 28
1.3.5 亚洲表观遗传项目 29
1.4 小结 29
参考文献 29
2 DNA甲基化调控与哺乳动物的发育 33
2.1 不同基因组区域的DNA甲基化 35
2.1.1 CpG岛 35
2.1.2 基因主体区 36
2.1.3 基因间隔区 36
2.2 DNA甲基化的基本机制 36
2.3 DNA去甲基化 38
2.4 读取DNA甲基化 40
2.5 DNA甲基化与其他表观遗传学机制间的联系 41
2.5.1 DNA甲基化与组蛋白修饰的联系 41
2.5.2 DNA甲基化与miRNA的联系 43
2.6 发育中的DNA甲基化 43
2.6.1 胚胎早期发育中的DNA甲基化 43
2.6.2 神经系统发育中的DNA甲基化 46
2.7 隔代表观遗传 48
2.7.1 表观遗传差异和获得性遗传 50
2.7.2 生殖系统的重编程 51
2.7.3 隔代表观遗传对人类健康的影响 52
2.8 小结 53
参考文献 54
3 DNA甲基化的化学与生物学基础 66
3.1 DNA甲基化 67
3.1.1 DNA甲基化的概念 67
3.1.2 DNA甲基化的分布与功能 69
3.2 DNA甲基化谱式的建立及维持 70
3.2.1 DNA甲基转移酶 70
3.2.2 哺乳动物DNA甲基转移酶的表达分布及功能研究 70
3.2.3 起始性DNA甲基化的发生机制 72
3.2.4 维持性DNA甲基化的发生机制 76
3.2.5 DNA甲基化的分析方法 77
3.3 DNA去甲基化 79
3.3.1 小鼠胚胎发育过程中的DNA甲基化重编程 80
3.3.2 DNA去甲基化的可能途径 82
3.4 TET蛋白与DNA氧化去甲基化 85
3.4.1 TET蛋白和5hmC的发现 85
3.4.2 5hmC在基因组上的分布 86
3.4.3 TET蛋白介导的DNA去甲基化 86
3.4.4 TET蛋白介导的氧化去甲基化的其他途径 87
3.4.5 TET蛋白及其介导的5mC氧化在发育过程中的功能 89
3.5 小结 92
参考文献 92
4 DNA甲基化与肿瘤的精准诊疗 96
4.1 概述 96
4.1.1 肿瘤特征性DNA甲基化异常的遗传学根源 99
4.1.2 DNA甲基化异常是肿瘤基因组DNA序列改变的机制之 100
4.1.3 DNA甲基化异常是肿瘤形成进程中的早发和频发事件 101
4.1.4 DNA甲基化是优点突出、应用潜力巨大的肿瘤诊断生物标志物 102
4.1.5 DNA甲基转移酶抑制剂与抗肿瘤治疗 104
4.2 发现肿瘤驱动性DNA甲基化的组学研究 105
4.3 肿瘤特征性DNA甲基化谱式的异常 110
4.4 DNA甲基化与肿瘤的精准诊断 112
4.4.1 亚硫酸氢盐处理类的技术 114
4.4.2 非亚硫酸氢盐处理类的技术 115
4.5 DNA甲基化分析与肿瘤精准诊断：机遇和挑战 115
4.6 展望 118
4.6.1 基因的转录状态与ctDNA为样本的肿瘤诊断 118
4.6.2 ctDNA的DNA甲基化分析方法的优化 119
4.7 小结 119
参考文献 120
5组蛋白修饰的化学与生物学基础 132
5.1 组蛋白修饰概述 132
5.2 组蛋白修饰的产生——书写器 134
5.3 组蛋白修饰的消除——擦除器 139
5.4 组蛋白修饰的识别——阅读器 142
5.5 组蛋白修饰及识别蛋白的发现与鉴定 147
5.6 组蛋白修饰的调控 149
5.6.1 组蛋白修饰间的交叉对话 149
5.6.2 组蛋白修饰对基因表达的影响 150
5.6.3 组蛋白修饰与染色质重塑 151
5.6.4 组蛋白修饰与DNA修复 151
5.7 组蛋白修饰与DNA修饰的交叉对话 152
5.8 小结 153
参考文献 154
6 表观遗传药物与疾病的精准治疗 158
6.1 表观遗传调控异常与疾病 158
6.1.1 DNA甲基化紊乱 159
6.1.2 组蛋白修饰异常 160
6.1.3 致癌组蛋白 163
6.1.4 染色质重塑因子紊乱 164
6.2 分子病因分类举例 165
6.2.1 DNA甲基化修饰的调控异常 165
6.2.2 组蛋白共价修饰的调控异常 166
6.2.3 染色质重塑的调控异常 169
6.3 表观遗传因子靶向药物的研发历史与现状 170
6.3.1 DNA甲基转移酶抑制药物 170
6.3.2 组蛋白去乙酰化酶抑制药物 175
6.3.3 组蛋白甲基转移酶和去甲基化酶抑制药物 177
6.3.4 组蛋白乙酰化识别抑制药物 179
6.4 工具小分子和药物研发流程简介 180
6.5 表观遗传在精准医疗中应用的现状和展望 186
6.6 小结 187
参考文献 188
7 染色质的高级结构（一）：核小体与30nm染色质纤维 194
7.1 染色质结构概述 194
7.2 核小体的结构：染色质结构的基本结构单元 195
7.3 核小体的动态调控 196
7.4 染色质纤维的结构：30nm染色质的高精度结构 200
7.5 染色质纤维结构的动态调控 203
7.5.1 连接组蛋白H1 203
7.5.2 组蛋白变体 205
7.5.3 染色质修饰 206
7.5.4 染色质结合蛋白 206
7.6 细胞核内染色质纤维结构与功能 207
7.6.1 细胞核内30nm染色质纤维结构 207
7.6.2 细胞核内染色质纤维结构的动态调控 209
7.7 染色质结构与精准医学 215
7.7.1 染色质结构与肿瘤和其他疾病的诊断 215
7.7.2 染色质结构与肿瘤起源和转移 217
7.7.3 染色质结构与肿瘤的治疗 218
7.7.4 核小体定位指纹与肿瘤自身免疫病的临床诊断 219
7.8 小结 220
参考文献 221
8染色质的高级结构（二）：三维基因组学与精准医学 227
8.1 基因组结构和功能的联系 227
8.2 基因组结构简介 229
8.3 研究基因组三维结构的方法 233
8.3.1 基因组三维构象捕获的荧光显微实验方法 233
8.3.2 染色体构象捕获技术 235
8.4 三维基因组数据处理、结构识别以及三维建模 241
8.5 三维基因组学的初步应用 248
8.5.1 Hi-C技术的应用：区室结构和拓扑结构域 248
8.5.2 ChIA-PET技术的应用 251
8.5.3 基因组三维结构与基因组组装 254
8.5.4 基因组三维结构与功能 254
8.6 三维基因组学和精准医学 256
8.6.1 基因组三维结构与疾病的关系 256
8.6.2 基因组三维结构与疾病相关全基因组关联分析位点的目标基因 257
8.7 小结 259
参考文献 260
9 基因组的暗物质：长非编码RNA 269
9.1 长非编码RNA的分类与新型非编码RNA的发现 270
9.1.1 含有poly（A）尾的长非编码RNA 271
9.1.2 新型非编码RNA的发现：无poly（A）尾的长非编码RNA 273
9.2 长非编码RNA的生物学功能 277
9.2.1 基因表达调控 277
9.2.2 生长发育调控 279
9.2.3 长非编码RNA与疾病 281
9.3 长非编码RNA的作用机制 282
9.3.1 长非编码RNA作为信号分子 282
9.3.2 长非编码RNA作为诱饵分子 283
9.3.3 长非编码RNA作为向导分子 284
9.3.4 长非编码RNA作为支架分子 285
9.3.5 长非编码RNA通过RNA-RNA相互作用调控基因表达 286
9.4 非编码RNA研究技术 288
9.4.1 非编码RNA的鉴定技术手段 288
9.4.2 非编码RNA功能研究的技术手段 290
9.4.3 非编码RNA作用机制研究的技术手段 292
9.5 小结 294
参考文献 295
10 非编码RNA与恶性肿瘤的精准诊疗 297
10.1 非编码RNA在恶性肿瘤发生发展中的作用及分子机制 297
10.1.1 非编码RNA在恶性肿瘤中异常表达 298
10.1.2 非编码RNA在恶性肿瘤发生发展过程中的作用及分子机制 299
10.2 非编码RNA在恶性肿瘤诊断中的意义及应用 301
10.2.1 非编码RNA的特征及其在恶性肿瘤诊断中的意义 301
10.2.2 非编码RNA在恶性肿瘤早期诊断中的应用 303
10.2.3 非编码RNA在肿瘤鉴别诊断中的应用 306
10.2.4 非编码RNA在恶性肿瘤诊断中的问题和展望 306
10.3 非编码RNA在恶性肿瘤进展预测中的意义及应用 307
10.3.1 非编码RNA在恶性肿瘤进展中的作用和分子机制 307
10.3.2 非编码RNA在恶性肿瘤侵袭和转移预测中的应用 309
10.3.3 非编码RNA在恶性肿瘤复发和预后预测中的应用 310
10.4 非编码RNA在恶性肿瘤分型中的意义及应用 312
10.4.1 非编码RNA在恶性肿瘤分型中的意义 312
10.4.2 miRNA作为恶性肿瘤分型的分子标志物 313
10.4.3 长非编码RNA作为恶性肿瘤分型的分子标志物 314
10.5 非编码RNA在恶性肿瘤疗效监测中的意义及应用 315
10.5.1 非编码RNA作为化疗耐药的分子标志物 316
10.5.2 非编码RNA作为靶向药物的分子标志物 317
10.5.3 非编码RNA在放射治疗疗效监测中的应用 318
10.5.4 非编码RNA在术前术后疗效监测中的应用 319
10.6 非编码RNA在恶性肿瘤治疗中的意义及应用 320
10.6.1 miRNA在恶性肿瘤治疗中的应用 320
10.6.2 其他非编码RNA在恶性肿瘤治疗中的应用研究 321
10.6.3 非编码RNA在恶性肿瘤治疗中的策略及问题 322
10.7 非编码RNA的常用检测方法与技术 323
10.7.1 RNA印迹法 323
10.7.2 RNA原位杂交 324
10.7.3 实时荧光定量PCR 324
10.7.4 微阵列芯片 325
10.7.5 高通量RNA测序 326
10.7.6 纳米孔单分子技术 326
10.8 小结 326
参考文献 327
11 RNA修饰与疾病的精准诊疗 332
11.1 RNA化学修饰类型 332
11.1.1 mRNA的甲基化修饰 333
11.1.2 tRNA的甲基化修饰 336
11.1.3 rRNA的甲基化修饰 336
11.1.4 snRNA的甲基化修饰 337
11.1.5 miRNA/piRNA的甲基化修饰 337
11.2 RNA甲基化修饰酶及调控蛋白 337
11.2.1 m6A的甲基化修饰酶及调控蛋白 338
11.2.2 m5C的甲基化修饰酶及调控蛋白 341
11.2.3 m1A的甲基化修饰酶及调控蛋白 343
11.2.4 假尿嘧啶的甲基化修饰酶及调控蛋白 343
11.2.5 m6Am的甲基化修饰酶及调控蛋白 344
11.3 RNA化学修饰的检测技术 344
11.3.1 RNA修饰的定量检测技术 344
11.3.2 RNA修饰的定点检测技术 346
11.3.3 RNA修饰的高通量测序技术 347
11.4 RNA化学修饰的分布规律 358
11.4.1 m6A修饰的分布规律 358
11.4.2 m5C修饰的分布规律 361
11.4.3 m1A修饰的分布规律 362
11.4.4 假尿嘧啶修饰的分布规律 363
11.5 RNA化学修饰在RNA加工过程中的调控功能 365
11.5.1 m7G修饰在RNA加工过程中的调控功能 365
11.5.2 Nm修饰在RNA加工过程中的调控功能 366
11.5.3 m2G和m3G修饰在RNA加工过程中的调控功能 366
11.5.4 m6A修饰在RNA加工过程中的调控功能 366
11.5.5 m5C修饰在RNA加工过程中的调控功能 370
11.5.6 m1A修饰在RNA加工过程中的调控功能 371
11.5.7 假尿嘧啶修饰在RNA加工过程中的调控功能 371
11.5.8 m6Am修饰在RNA加工过程中的调控功能 372
11.6 RNA化学修饰的生理病理效应 372
11.6.1 m6A调控发育 372
11.6.2 m6A与配子发生 373
11.6.3 m6A与细胞重编程 374
11.6.4 m6A与生物节律 375
11.6.5 m6A与细胞分裂 375
11.6.6 m6A与母体－合子过渡 376
11.6.7 m6A与lncRNA XIST介导的转录抑制 376
11.6.8 m6A与果蝇性别决定 376
11.6.9 m6A与癌症 377
11.6.10 m6A与RNA病毒感染 377
11.6.11 m6A与DNA损伤修复 377
11.6.12 假尿嘧啶与人类疾病 378
11.7 小结 379
参考文献 379
12表观遗传介导的细胞命运改变和再生医学 385
12.1 体细胞重编程和表观遗传学 387
12.1.1 基本的体细胞重编程 388
12.1.2 组蛋白修饰对重编程的不同影响 389
12.1.3 DNA甲基化与重编程 392
12.1.4 染色体组蛋白变体 394
12.1.5 染色质重塑复合物和组蛋白分子伴侣对重编程的影响 395
12.2 干细胞分化和表观遗传学 397
12.2.1 DNA甲基化与干细胞定向诱导分化 398
12.2.2 染色质状态与干细胞定向诱导分化 399
12.2.3 非编码RNA和干细胞定向诱导分化 400
12.3 谱系重编程和表观遗传学 403
12.4 小结 404
参考文献 405
13表观遗传重编程与疾病的精准治疗 408
13.1 表观遗传重编程的方法与机制 408
13.1.1 体细胞核移植 408
13.1.2 诱导性多能干细胞 412
13.1.3 细胞转分化 416
13.2 表观遗传重编程介导的精准治疗 419
13.2.1 细胞重编程在疾病发生机制研究中的应用 419
13.2.2 细胞重编程在药物筛选中的应用 425
13.2.3 细胞重编程在再生医学中的应用 428
13.3 小结 431
参考文献 432
14中医药理论与实践的表观遗传学基础 437
14.1 中医药学与表观遗传学的联系 437
14.2 中医学证候理论与表观遗传学 438
14.3 中药复方及其有效成分的表观遗传学机制 439
14.3.1 传统中药复方的表观遗传学作用机制 440
14.3.2 中药有效成分的表观遗传学作用机制 441
14.3.3 对于中药药性的表观遗传学研究 443
14.4 中医针灸的表观遗传学研究 443
14.5 现有中医药表观遗传学研究的不足和展望 444
14.6 小结 445
参考文献 445
索引 448