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第一章 绪论 1

第一节 病原病毒的发现 1

第二节 病原病毒及其本质 2

第三节 植物病原病毒与病毒病害 3

第四节 植物病原病毒学的内容 5

第二章 植物病毒的特征 7

第一节 植物病毒的形态与结构 7

一、病毒的形态 7

二、病毒粒体的结构 9

第二节 植物病毒的化学组成 12

一、病毒的核酸 12

二、病毒的蛋白质 13

三、病毒中的其他化学物质 13

第三节 植物病毒的基因组特征 14

一、单链正义RNA病毒 14

二、单链负义RNA病毒 17

三、双链RNA病毒 18

四、单链及双链DNA病毒 18

第四节 病毒编码的蛋白质种类及其功能 18

一、外壳蛋白 20

二、复制蛋白和复制增强蛋白 20

三、与运动有关的病毒蛋白及功能 22

第三章 DNA病毒的分子生物学 26

第一节 双生病毒科的分子生物学 26

一、双生病毒科的基因组结构 26

二、双生病毒科的复制 29

三、双生病毒科的转录 32

第二节 矮缩病毒科的分子生物学 33

第三节 花椰菜花叶病毒科的分子生物学 35

一、花椰菜花叶病毒科的基因组结构 36

二、花椰菜花叶病毒的复制 38

第四章 RNA病毒的分子生物学 43

第一节 RNA病毒基因组的组成和结构 43

一、基因组组成和结构的一般特性 43

二、正链RNA病毒基因组的组成和结构 44

三、负链RNA基因组病毒的组成和结构 69

四、双链RNA病毒基因组的组成和结构 70

第二节 RNA病毒的基因表达和调控 71

一、mRNA合成 71

二、真核生物蛋白质合成系统 73

三、植物病毒RNA表达策略 73

四、植物RNA病毒使用多种策略表达基因组编码的基因 79

五、植物病毒翻译过程的调控 80

第三节 RNA病毒的复制 83

一、RNA复制酶 83

二、构成复制酶复合体的各蛋白质之间的相互作用和复制酶的组装 87

三、模板识别和复制起始 87

四、RNA复制从起始到延长的转换 92

五、病毒RNA在细胞内膜上的复制 93

六、gRNA复制与sgRNA转录的关系和调控 94

七、RNA翻译（蛋白质合成）与RNA复制的调控 95

八、正负链RNA的不对称合成 95

第五章 植物病毒的变异、进化和起源 113

第一节 植物病毒的变异 114

一、植物病毒变异概述 114

二、植物病毒种群的准种结构 115

第二节 病毒变异的分子基础 117

一、突变 117

二、重组 118

三、重排 119

四、基因重复 120

五、基因重叠 121

第三节 病毒在种群中的分子进化机制 122

一、分子进化的理论模型 122

二、遗传漂移 123

三、选择 125

四、互补作用 127

第四节 病毒的模块进化 127

一、微观进化和宏观进化 127

二、模块进化理论 128

三、病毒基因组中的功能模块及其进化 128

第五节 病毒的起源 132

一、退化论 133

二、起源于最原始的能自我复制的分子 133

三、起源于寄主-细胞RNA和／或DNA组分 134

第六章 植物病毒的分类与命名 141

第一节 病毒分类进程 141

第二节 病毒分类和命名准则 143

第三节 病毒名称缩写原则 145

第四节 病毒分类依据 146

第五节 植物病毒分类系统 147

第七章 植物病毒的分离与提纯 155

第一节 病毒分离提纯的基本原理 155

第二节 病毒的分离 155

第三节 病毒的毒源繁殖 156

第四节 病毒的提纯 158

一、抽提介质的准备 158

二、植物组织和细胞破碎 159

三、植物病毒的粗提纯 160

四、病毒的精提纯 161

五、提纯病毒的保存 162

第八章 植物病毒的侵染与增殖 164

第一节 病毒的侵染 164

一、吸附和侵入 164

二、脱壳 165

第二节 病毒的增殖 166

一、病毒核酸的复制 166

二、病毒蛋白的合成 167

第三节 病毒的装配 167

一、装配 168

二、成熟 169

第四节 病毒的扩散、运输与分布 169

一、病毒在细胞间的移动 169

二、病毒的长距离运输 173

三、病毒在寄主体内的分布 174

第九章 植物病毒与寄主植物的互作 178

第一节 致病性与抗病性 178

一、致病性与抗病性的类型 178

二、致病性与抗病性的基础 179

第二节 基因沉默及其抑制 180

一、基因沉默作用 180

二、基因沉默的抑制 183

三、避免PTGS的其他机制 185

第三节 诱导抗性和信号转导 186

一、局部获得性抗性 186

二、系统获得抗性与信号转导 186

第四节 抗性遗传 190

一、抗病毒基因 191

二、病毒在初侵染细胞中复制的能力 193

三、病毒从第一个细胞迁移出的能力 194

四、TMV在N基因烟草中诱发的HR 194

五、其他病毒—寄主过敏性反应 195

第五节 病毒对寄主基因表达的调控 197

一、病毒侵染对寄主细胞中核酸与蛋白质的影响 197

二、发生过敏性反应的寄主中蛋白质的变化 198

三、病毒侵染对寄主细胞的其他影响 199

四、病毒与植物在分子水平上的互作 200

第十章 类病毒、卫星病毒及卫星核酸 207

第一节 类病毒 207

一、类病毒的生物学特性 207

二、类病毒的种类及分子结构 208

三、类病毒RNA的复制与剪切加工 211

四、类病毒的移动 212

五、类病毒的检测与防治 213

第二节 卫星病毒 214

第三节 卫星核酸 215

一、卫星DNA 216

二、卫星RNA 218

第十一章 植物病毒的诊断与检测 224

第一节 生物学测定法 225

一、侵染性测定 225

二、指示植物测定 226

三、寄主范围测定 227

四、传播方式测定 227

五、细胞内含体测定 227

第二节 电子显微镜测定法 228

一、负染色法 228

二、超薄切片法 229

三、免疫电镜法 229

第三节 血清学测定法 230

一、抗原和抗体 230

二、植物病毒抗血清的制备 231

三、酶联免疫吸附测定法 232

四、免疫印迹法 233

五、免疫试条法 233

第四节 分子生物学测定法 234

一、双链RNA技术 234

二、核酸分子杂交 234

三、多聚酶链式反应 235

第十二章 植物病毒的寄主反应与寄主范围 241

第一节 植物病毒病的症状 241

一、症状类型 241

二、局部症状和系统症状 244

三、病毒病症状的复杂性 244

四、病毒引起植物症状的分子机理 245

第二节 植物病毒的细胞病理学 246

一、寄主植物的细胞病变 246

二、病毒内含体 247

第三节 植物病毒的病理生理学 249

第四节 植物病毒的寄主范围 250

第十三章 植物病毒的传播 253

第一节 病毒传播的方式 253

第二节 病毒的介体传播 254

一、昆虫介体 256

二、线虫介体 257

三、真菌介体 258

四、脊椎动物传毒介体 258

五、寄生性种子植物 258

第三节 病原病毒介体传播的基本模式 258

一、病毒介体的传毒模式 259

二、介体特异性传毒的机制 260

第四节 病毒介体昆虫传播的分子基础 262

一、黄瓜花叶病毒属 263

二、马铃薯Y病毒属 263

三、花椰菜花叶病毒 264

四、其他非循回式病毒 265

五、黄症病毒属 265

六、双生病毒 267

七、其他非增殖型病毒 267

八、循回式增殖型病毒 268

第五节 介体线虫和真菌传播病毒的分子基础 269

一、线虫传病毒 269

二、真菌传病毒 271

第六节 植物病毒的种子和花粉传播 273

第七节 结语 277

第十四章 植物病毒的生态学与流行学 291

第一节 植物病毒生态学 291

第二节 植物病毒流行学 292

一、病毒病害流行的时间动态 292

二、病害流行的空间动态 293

第三节 影响植物病毒传播和流行的因素 294

一、生物因子对病毒传播和流行的影响 294

二、非生物因子对病毒传播和流行的影响 300

第四节 植物病毒病害的流行模式和梯度 301

一、流行模式 301

二、病害梯度 301

第十五章 植物病毒病害的管理 305

第一节 病毒病害管理的基本原则 305

第二节 病毒病害管理的基本途径 305

一、宏观生态管理 305

二、微观生态管理 313

第三节 抗病毒基因工程 314

一、抗病毒基因工程策略 314

二、植物抗病毒基因工程的安全性 319

第四节 抗病毒活性物质 321