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第一篇 真菌生物学 2

第一章 绪论 2

第一节 真菌学的发展史 2

一、古代真菌学时期（ —1860） 2

二、近代真菌学时期（1861—1950） 3

三、真菌学全面发展时期（1951—1995） 4

四、真菌基因组学时期（1996— ） 5

第二节 真菌与人类的关系 6

一、真菌的工业利用 6

二、真菌与农业生产 7

三、真菌与医疗卫生 7

四、真菌与生物技术 8

第三节 我国真菌学的发展概况 9

第二章 真菌的营养体 11

第一节 丝状真菌的营养体 11

一、菌丝的一般结构 11

二、无隔菌丝和有隔菌丝 12

三、菌落 13

四、菌丝融合 15

五、菌丝的组织 16

第二节 菌丝的变态和特殊营养体 16

一、菌丝的变态 16

二、菌丝特殊的营养体 18

第三节 单细胞真菌——酵母 21

一、酵母的形态 21

二、酵母的细胞结构 22

三、酵母的出芽现象 23

四、酵母的细胞循环 23

复习题 25

第三章 真菌的细胞结构与功能 26

第一节 细胞壁 26

一、真菌细胞壁的主要成分 26

二、真菌细胞壁的分子结构 30

第二节 原生质膜 32

一、膜的结构 33

二、物质的穿膜运输 34

第三节 细胞核 37

一、细胞核的结构特征 37

二、染色体和基因组 37

三、细胞核与细胞分裂 38

第四节 线粒体、氢化酶体和核糖体 39

一、线粒体和线粒体DNA 39

二、氢化酶体 41

三、核糖体 42

第五节 内膜系统 43

一、内质网 43

二、高尔基体 43

三、液泡和泡囊 44

四、膜边体 45

第六节 细胞骨架和细胞质的移动 45

一、细胞骨架 45

二、微管与鞭毛 47

三、细胞质的移动 47

第七节 其他内含体 48

一、微体 48

二、沃鲁宁体 49

三、壳质体 49

复习题 50

第四章 真菌的营养 51

第一节 碳素营养 51

一、单糖和双糖 51

二、大分子糖类 54

三、醇类 55

四、脂肪酸和碳氢化合物 56

五、固定CO2 57

第二节 氮素营养 58

一、氮源利用的一般途径 58

二、硝酸盐 58

三、亚硝酸盐 59

四、铵 60

五、尿素 61

六、有机氮 61

第三节 无机营养 61

一、镁 62

二、磷 62

三、钾 63

四、硫 64

五、钙 64

六、铁 65

七、铜 65

八、锌 66

九、锰 67

第四节 维生素和生长因子 67

一、维生素 68

二、生长因子 69

复习题 70

第五章 真菌的生长 71

第一节 丝状真菌的生长 71

一、丝状真菌的生长机制 71

二、真菌的分支生长 74

三、生长的动力学 75

第二节 单细胞真菌的生长 76

一、酵母的生长方式 76

二、酵母的出芽机制 78

三、酵母的生活史 80

第三节 真菌的两型现象 81

一、温度依赖型两型现象 81

二、温度和营养依赖型两型现象 82

三、营养依赖型两型现象 82

四、血清诱导促发的两型现象 83

第四节 真菌生长的测定 83

一、直线生长的测定 83

二、测定菌丝干重法 84

第五节 环境因子对生长的影响与极端环境的耐受性 84

一、水 84

二、温度 85

三、氢离子浓度 85

四、光照 86

五、通气 86

第六节 真菌生长的抑制剂 86

一、生化特异性低的真菌抑制剂 86

二、生化特异性高的真菌抑制剂 87

三、小结 89

复习题 89

第六章 真菌的生殖 90

第一节 无性繁殖和孢子类型 90

一、游动孢子 90

二、孢囊孢子 91

三、分生孢子 92

第二节 有性生殖和孢子类型 95

一、性的亲和性 95

二、性细胞结合的方式 98

三、有性孢子类型 99

第三节 生殖器官的形态建成 100

一、绵霉属 101

二、异水霉属 102

三、毛霉目 102

四、酵母 103

第四节 真菌的生活史 104

第五节 影响真菌生殖的营养条件和物理因素 105

一、营养条件 105

二、物理因素 107

复习题 108

第七章 真菌的代谢 109

第一节 碳代谢 109

一、发酵和呼吸的概念 109

二、糖酵解 109

三、无氧呼吸 113

四、有氧呼吸 114

五、真菌碳化合物的合成 118

第二节 氨基酸代谢 120

一、脱氨和转氨反应 120

二、谷氨酸的交叉途径 121

三、氨基酸的生物合成&“ 121

第三节 脂代谢 125

一、真菌产生的脂质 125

二、脂质的分解代谢 126

三、脂肪酸的生物合成 126

四、多不饱和脂肪酸的合成 127

第四节 次生代谢物 129

一、类胡萝卜素 129

二、赤霉素 131

三、麦角生物碱 132

四、青霉素和头孢菌素 133

五、环孢菌素A 135

六、黄曲霉毒素 137

七、甾体转化 138

复习题 139

第八章 真菌的遗传 140

第一节 真菌遗传学的特点 140

第二节 脉孢菌及其遗传分析 142

一、脉孢菌的生活史 142

二、四分体分析 142

第三节 利用标记基因研究染色体交换 144

一、染色体交换 144

二、着丝粒距离 145

三、标记基因的选择 146

第四节 异核现象、准性生殖和营养菌丝的不亲和性 147

一、异核现象 147

二、准性生殖 148

三、营养菌丝的不亲和性 151

第五节 真菌的交配系统 152

一、两种交配型的繁殖系统 152

二、多交配型的单因素繁殖系统 153

三、双因素杂交系统 153

第六节 细胞质遗传 154

第七节 真菌的DNA转化 155

一、转化的方法 155

二、选择标记 157

三、载体类型和转入的DNA在细胞中的归宿 158

四、转化的应用 158

复习题 161

第九章 真菌孢子的释放、传播、休眠和萌发 162

第一节 真菌孢子形成的营养与环境因素 162

一、孢子形成与营养 162

二、孢子形成的光效应 163

三、孢子形成的其他因子效应 165

四、孢子形成与孢子形态 165

第二节 孢子的释放 166

一、真菌孢子的被动释放 166

二、真菌孢子的主动释放 167

第三节 孢子的传播 169

一、空气传播 169

二、水传播 170

三、动物传播 171

第四节 孢子的休眠 171

一、外源性休眠 172

二、内源性休眠 173

第五节 孢子的激活 174

一、温度处理 174

二、化学试剂处理 175

三、后熟 175

四、复合处理 176

第六节 孢子的萌发 176

一、孢子萌发前期的代谢变化 176

二、萌发期间形态学变化 177

三、萌发期间代谢的改变 177

四、萌发管的生长及定向 179

复习题 179

第十章 腐生真菌和真菌毒素 180

第一节 分解作用 180

一、物质分解的过程 180

二、半纤维素的分解 181

三、纤维素的分解 182

四、木质素的分解 182

第二节 腐生真菌的群落和演替 183

一、研究真菌群落的方法 183

二、土壤真菌的拮抗作用 186

三、土壤真菌的演替 187

第三节 木材腐生真菌 190

一、软腐真菌 191

二、褐腐真菌 191

三、白腐真菌 192

第四节 水生真菌 193

一、淡水真菌 193

二、海洋真菌 195

第五节 真菌引起的物质腐败 195

一、木材和木材制品 196

二、纸张 196

三、纺织品 196

四、食品腐败 197

第六节 真菌毒素 197

一、真菌在粮食和饲料中的带染 198

二、真菌产毒的条件 198

三、真菌毒素中毒症 201

复习题 204

第十一章 寄生真菌和捕食真菌 205

第一节 人体真菌病 205

一、表皮真菌病 205

二、系统性真菌病 207

第二节 植物体寄生真菌 212

一、植物感染的起始期——黏附 212

二、识别现象 214

三、真菌孢子在植物表面的萌发 215

四、真菌对植物的入侵 216

五、真菌在植物中的定居和感染 218

六、对植物正常生长和生理过程的干扰 221

七、影响疾病发生的因素和疾病周期 222

八、小结 223

第三节 动物体寄生真菌 223

一、节肢动物寄生菌 224

二、动物和鸟类寄生真菌 226

三、两栖动物和鱼类的寄生真菌 227

第四节 捕食真菌 227

一、捕虫霉目的捕食真菌 228

二、丛梗孢科的捕食真菌 228

三、捕食真菌的研究概况 230

复习题 230

第十二章 共生真菌和真菌病毒 231

第一节 地衣 231

一、地衣的生物学 231

二、地衣共生体相互作用的本质 234

三、地衣的分类 235

第二节 菌根 236

一、外生菌根 236

二、VA菌根 238

三、兰科菌根 239

四、杜鹃科菌根 240

五、蜜环菌与天麻 241

第三节 内生真菌 241

一、内生真菌的生态学 241

二、内生真菌与寄主植物的生物学 242

三、内生真菌的传播方式 243

四、研究植物内生真菌的意义 245

第四节 昆虫共生真菌 245

一、昆虫内共生真菌 245

二、昆虫外共生真菌 246

第五节 真菌病毒 246

一、真菌病毒的结构 247

二、真菌病毒的复制 247

三、病毒对寄主真菌的影响 248

四、传布 248

复习题 249

第十三章 真菌的系统进化 250

第一节 真菌在自然界中的地位 250

一、生物各界的演变 250

二、真菌在自然界中的地位 252

三、卵菌门分类地位演变的依据 254

第二节 真菌的系统进化 255

一、真菌各类群的系统发育树 255

二、真菌界的系统进化 256

三、进化真菌学提出的几个相关问题 260

第三节 真菌系统发育树的构建 261

一、表型特征 261

二、进化指征 261

三、系统树的构建 263

复习题 269

第十四章 真菌基因组学 270

第一节 概述 270

一、关于基因组的定义 270

二、基因组学的术语 271

三、数据库 272

第二节 全基因组测序 273

一、图谱 273

二、测序和装配 274

三、注释 275

第三节 功能基因组学和比较基因组学 276

一、功能基因组学 276

二、比较基因组学 277

第四节 真菌基因组纵览 278

一、已测序真菌的染色体和基因组信息 278

二、真菌基因组纵览 281

复习题 286

第二篇 真菌的分类学 288

第十五章 真菌的基本类群及其分类概况 288

第一节 真菌的基本类群和分类系统 288

一、真菌的基本类群 288

二、真菌的命名及数量估测 289

三、真菌的主要分类系统 290

第二节 三个不同的界级类群中的真菌概况 292

复习题 298

第十六章 壶菌门（Chytridiomycota） 299

第一节 概述 299

一、生活习性 299

二、营养体 299

三、无性繁殖 300

四、有性生殖 300

五、分类 301

第二节 壶菌纲（Chytridiomycetes） 301

一、壶菌目（Chytridiales） 301

二、芽枝霉目（Blastocladiales） 304

三、单毛菌目（Monoblepharidales） 305

四、肋壶菌目（Harpochytriales） 306

五、新丽乳香菌目（Neocallimasticales） 306

复习题 307

第十七章 接合菌门（Zygomycota） 308

第一节 概述 308

第二节 接合菌纲（Zygomycetes） 308

一、毛霉目（Mucorales） 309

二、虫霉目（Entomophthorales） 319

三、捕虫霉目（Zoopagales） 320

第三节 毛菌纲（Trichomycetes） 320

一、营养体 321

二、无性繁殖 321

三、有性生殖 321

四、分类 321

五、本纲代表属 321

复习题 321

第十八章 子囊菌门（Ascomycota） 323

第一节 形态特征和分类 323

一、概述 323

二、营养体 323

三、无性繁殖 323

四、有性生殖 324

五、子囊果 325

六、分类 326

第二节 半子囊菌纲（Hemiascomycetes） 327

一、内孢霉目（Endomycetales） 327

二、外囊菌目（Taphrinales） 330

第三节 不整囊菌纲（Plectomycetes） 330

散囊菌目（Eurotiales） 331

第四节 核菌纲（Pyrenomycetes） 332

一、白粉菌目（Erysiphales） 333

二、小煤炱目（Meliolales） 334

三、冠囊菌目（Coronophorales） 335

四、球壳目（Sphaeriales） 335

第五节 腔菌纲（Leculoascomycetes） 342

一、多腔菌目（Myriangiales） 343

二、座囊菌目（Dothideales） 343

三、格孢腔菌目（Pleosporales） 344

四、缝裂菌目（Hysteriales） 346

五、半球腔菌目（Hemisphaeriales） 346

第六节 盘菌纲（Discomycetes） 347

一、梭绒盘菌目（Medeolariales） 348

二、瘿果盘菌目（Cyttariales） 348

三、块菌目（Tuberales） 349

四、盘菌目（Pezizales） 349

五、星裂盘菌目（Phacidiales） 351

六、厚顶盘菌目（Ostropales） 352

七、柔膜菌目（Helotiales） 352

第七节 虫囊菌纲（Laboulbeniomycetes） 353

一、营养体 353

二、有性生殖 354

三、分类 354

复习题 354

第十九章 担子菌门（Basidiomycota） 356

第一节 概述 356

一、营养体 356

二、无性繁殖 357

三、有性生殖 357

四、担子果（子实体） 357

五、担子 358

六、担孢子 359

七、担子菌的起源 359

八、分类 359

第二节 冬孢菌纲（Teliomycetes） 360

一、锈菌目（Uredinales） 360

二、黑粉菌目（Ustilaginales） 364

第三节 层菌纲（Hymenomycetes） 367

一、银耳目（Tremellales） 367

二、木耳目（Auriculariales） 368

三、隔担菌目（Septobasidiales） 368

四、外担菌目（Exobasidiales） 369

五、座担菌目（Brachybasidiales） 369

六、花耳目（Dacrymycetales） 369

七、胶膜菌目（Tulasnellales） 370

八、非褶菌目（Aphyllophorales） 370

九、伞菌目（Agaricales） 372

第四节 腹菌纲（Gasteromycetes） 377

一、腹菌目（Hymenogastrales） 379

二、鬼笔目（Phallales） 379

三、马勃目（Lycoperdales） 380

四、鸟巢菌目（Nidulariales） 380

五、硬皮马勃目（Sclerodermatales） 381

六、轴灰包目（Podaxales） 381

七、高腹菌目（Gautieriales） 381

八、柄灰包目（Tulostomatales） 381

九、黑腹菌目（Melanogastrales） 382

复习题 382

第二十章 半知菌类（Fungi Imperfecti） 383

第一节 概述 383

一、营养体 383

二、无性繁殖 383

三、准性生殖 384

四、半知菌分类的研究概况 384

五、分类 387

第二节 芽孢纲（Blastomycetes） 387

一、隐球酵母目（Cryptococcales） 387

二、掷孢酵母目（Sporobolomycetales） 388

第三节 丝孢纲（Hyphomycetes） 388

一、无孢目（Agonomycetales） 389

二、丝孢目（Hyphomycetales） 389

三、束梗孢目（Stilbellales） 396

四、瘤座孢目（Tuberculariales） 396

第四节 腔孢纲（Coelomycetes） 398

一、黑盘孢目（Melanconiales） 398

二、球壳孢目（Sphaeropsidales） 399

复习题 400

第二十一章 卵菌门（Oomycota） 401

第一节 卵菌门概述 401

一、营养体 401

二、无性繁殖 401

三、有性生殖 402

四、分类 402

第二节 水霉目（Saprolegniales） 403

一、营养体 403

二、无性繁殖 403

三、有性生殖 403

四、分类 404

第三节 水节霉目（Leptomitales） 405

一、营养体 405

二、无性繁殖 405

三、有性生殖 405

四、分类 405

第四节 霜霉目（Peronosporales） 406

一、营养体 406

二、无性繁殖 406

三、有性生殖 407

四、分类及代表科、属和种 407

复习题 411

第二十二章 根肿菌门（Plasmodiophoromycota） 412

一、营养体 412

二、无性繁殖 412

三、有性生殖和生活循环 412

四、分类和代表种 413

复习题 413

附录 414

拉丁学名与中文学名对照表 414

主要参考文献 428