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绪论 1

第1章 植物基因组的结构 7

1.1 导言 7

1.2 DNA的变化——数量 7

1.3 染色体变异 10

1.4 DNA变异的起源 13

1.5 多基因组的结果 23

1.6 小结 26

1.7 参考文献 27

2.1 导言 29

第2章 基本工具箱——获得功能基因组数据 29

2.2 克隆系统 30

2.3 测序策略和自动化技术 43

2.4 蛋白质分析 44

2.5 数据库与信息学 46

2.6 小结 49

2.7 参考文献 49

第3章 测序的策略 51

3.1 导言 51

3.2 完全基因组序列的获得 53

3.3 物理和遗传学图谱 54

3.4 制作物理图谱 55

3.5 基因组分段 57

3.6 基因组分段的方法 58

3.7 基因组测序策略 63

3.8 基因组分级分离途径 66

3.9 测序和数据加工 67

3.10 最有效的方法 68

3.11 “完全”基因组序列的可能目标 68

3.12 参考文献 71

第4章 寻找基因 73

4.1 导言 73

4.2 从基因组序列鉴定基因 74

4.3 全长cDNA的产生 78

4.4 全长cDNA测序 80

4.5 基因组注释 81

4.6 共线性 83

4.7 利用诱变确定基因 83

4.8 小结 91

4.9 参考文献 91

第5章 基因表达调控 93

5.1 导言 93

5.2 基因表达调控需要特异启动子序列 95

5.3 增强子元件在基因表达上的作用 96

5.4 5′端序列在基因表达中的地位 97

5.6 内含子在基因表达中的地位 98

5.5 3′端序列在基因表达中的地位 98

5.7 真核生物启动子的保守序列 99

5.8 反式作用因子调控基因表达 100

5.9 mRNA的稳定性 101

5.10 植物中化学调控基因的表达 102

5.11 染色质结构的影响 103

5.12 翻译调控 105

5.13 小结 105

5.14 参考文献 105

第6章 功能基因组学 107

6.1 导言 107

6.2 表达谱 109

6.3 蛋白质组 120

6.4 小结 127

6.5 参考文献 127

第7章 植物体与外界环境的相互作用 129

7.1 导言 129

7.2 生物因子的相互作用 130

7.3 非生物作用 139

7.4 参考文献 142

第8章 复杂性状的确定和操作 145

8.1 导言 145

8.3 分子标记系统 147

8.2 分子图谱 147

8.4 确定QTL 150

8.5 分子标记辅助选择 158

8.6 参考文献 162

第9章 生物信息学 165

9.1 导言 165

9.2 数据库 166

9.3 信息处理工具 169

9.4 蛋白质鉴定和比较 178

9.5 比较基因组学 180

9.6 数据的意义 181

9.8 参考文献 184

9.7 小结 184

第10章 生物伦理学和植物基因组学的未来 187

10.1 导言 187

10.2 安全问题 189

10.3 贸易问题 190

10.4 公众的态度 190

10.5 公共策略问题 194

10.6 小结 196

10.7 参考文献 196

后记 198

索引 199