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目录 1

序 1

前言 1

第一章　核糖核酸的历史和文献 1

主要参考文献 7

第二章　核糖核酸的结构多样性 8

第一节　核糖核酸的组成及其结构 8

第二节　核糖核酸的结构多样性 12

一、核糖核酸的组成复杂性 12

二、核糖核酸的二级结构元件 24

三、RNA中的碱基配对方式多种多样 24

四、RNA的？级结构及其结构元件 42

主要参考文献 48

小结 48

第三章　核糖核酸的调控功能和核糖核酸组学 50

第一节　核糖核酸的分类及非编码核糖核酸 50

一、核糖核酸的分类 50

二、非编码核糖核酸 53

三、细菌中的非编码RNA 56

第二节　非编码核糖核酸的调控功能 63

一、RNA指导的DNA阅读 63

二、依赖于RNA的RNA阅读 66

三、依赖于RNA的DNA改写 67

四、依赖于RNA的RNA改写 68

第三节 RNA世界 69

一、古代的RNA世界 69

二、隐匿的当代RNA世界 72

三、肌强直性营养不良的机制 1 75

一、核糖核酸组学的提出 76

第四节　核糖核酸组学 76

二、核糖核酸组学的研究内容与方法 78

小结 79

主要参考文献 80

第四章　小干扰RNA 85

第一节　植物转录后的基因沉默（PTGS） 85

一、导致基因沉默的各种途径 85

二、RNA降解机制 88

三、植物中PTGS的生物学意义 91

第二节 RNA介导的DNA甲基化（RdDM）、染色质修饰与基因沉默 92

一、RdDM的机制 93

二、RNA指导的染色质修饰 97

小结 101

主要参考文献 101

第五章　微小RNA 106

第一节 不同生物中miRNA的发现 107

一、线虫中的miRNA 107

二、寻找miRNA的方法 107

三、动物、植物中的miRNA 114

第二节　miRNA的特征 114

一、miRNA的长度 114

二、miRNA基因 115

三、生物间的保守性 115

四、时序性和组织特异性 117

五、miRNA的前体 119

第三节　miRNA的功能及作用原理 120

一、miRNA与生物体的发育分化 121

二、miRNA的作用原理 126

小结 130

主要参考文献 131

第一节 哺乳动物的剂量调控与Xist RNA 134

第六章　非信使RNA 134

一、Xist基因 135

二、胚胎中Xist介导染色体沉默的起始 138

三、Xist表达的调控、X染色体的计数和选择 139

四、Xist功能的机制 140

五、Xist RNA功能的一个模式 142

第二节 果蝇的剂量代偿与roX RNA 143

一、通过染色质修饰达到雄性特异性高效转录 143

二、roX RNA是染色质进入的位点 144

三、剂量代偿复合物 144

第三节 印记RNA 147

一、调控RNA 147

二、H19印记RNA 149

小结 153

主要参考文献 154

一、热激RNA欧米伽（hsrω RNA） 159

第七章　小可读框核糖核酸和微卫星RNA 159

第一节　小可读框核糖核酸 159

二、其他应激RNA 163

第二节 显性非编码微卫星扩展紊乱的RNA发病机制 172

一、DM1型肌强直性营养不良 172

二、DM2型肌强直性营养不良 174

小结 176

主要参考文献 176

第八章　snoRNA 180

第一节　两类指导修饰的snoRNA及其生物合成 181

一、反义C/D盒snoRNA 181

二、H/ACA snoRNA 183

三、snoRNP的生物合成 183

一、指导snRNA的修饰 186

第二节 snoRNA的新功能 186

二、孤儿snoRNA 187

三、脑特异印记snoRNA 188

第三节 snoRNA的进化与起源 190

一、古细菌中指导修饰的snoRNA 190

二、古细菌snoRNA指导tRNA的甲基化 191

小结 193

主要参考文献 194

第九章　核糖核酸应用技术 198

第一节　概论 198

一、三链形成脱氧寡核苷酸 199

二、G-四联体 202

三、核酶 206

四、配体核酸与体外筛选 209

五、引诱物 211

六、参与DNA甲基化的寡脱氧核苷酸 212

七、大规模无细胞蛋白质合成系统 212

八、核糖核酸研究为药物开发提供药靶 213

第二节 反义寡脱氧核糖核酸 214

一、作用原理 217

二、反义寡脱氧核苷酸的化学 218

三、反义ODN的药代动力学 221

第三节 RNA干扰与小分子干扰RNA及其应用 221

一、siRNA设计思想 222

二、siRNA的来源 223

三、细胞和整体生物导入siRNA的方法 224

四、RNA干扰技术在医学中的应用 225

小结 226

主要参考文献 227