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1介绍细胞 1

1.1细胞的同一性与多样性 1

1.1.1细胞在外形与功能方面变化巨大 2

1.1.2活细胞都有相似的基本化学组成和化学性质 3

1.1.3一切现代细胞明显地都是由同一祖先进化而来 4

1.1.4基因提供给细胞指令以形成细胞形态、功能和复杂的行为 5

1.2显微镜下的细胞 5

1.2.1光学显微镜的发明导致了细胞的发现 5

1.2.2在显微镜下可以看到细胞、细胞器甚至分子 7

1.3原核细胞 9

1.3.1原核生物是最多样化的细胞 11

1.3.2原核生物的世界被分为两类：真细菌和古细菌 11

1.4真核细胞 12

1.4.1细胞核是细胞的信息存储器 13

1.4.2线粒体利用食物产生能量而赋予细胞动力 14

1.4.3叶绿体从日光捕获能量 15

1.4.4内膜创建功能各异的胞内区室 16

1.4.5胞质溶胶是一种浓缩的大分子和小分子的含水凝胶 18

1.4.6细胞骨架负责细胞运动 19

1.4.7细胞质远远不是静态的 20

1.4.8真核细胞可能作为捕食者而起源 21

1.5模式生物 23

1.5.1分子生物学家聚焦于大肠杆菌 23

1.5.2酿酒酵母是一种简单的真核细胞 23

1.5.3从30万种植物中选出拟南芥作为模式植物 24

1.5.4动物界以果蝇、蠕虫、鼠和人为代表 24

我们如何得知：生命的共同机制 25

1.5.5比较基因组序列将揭示生命共同的遗传密码 30

图版1-1显微镜 32

图版1-2细胞结构 34

2细胞的化学成分 39

2. 1化学键 39

2.1.1细胞由少数几种原子组成 39

2.1.2最外层电子决定原子间如何相互作用 41

2.1.3电子的得失形成离子键 43

2.1.4共用电子对形成共价键 45

2.1.5共价键强度的变化 46

2.1.6共价键有不同的类型 47

2.1.7静电吸引力帮助细胞内的分子结合在一起 48

2.1.8水通过氢键结合在一起 48

2.1.9一些极性分子在水溶液中形成酸和碱 49

2.2细胞内的分子 50

2.2.1细胞由碳化合物构成 50

2.2.2细胞含有四种主要的有机小分子 50

2.2.3糖是细胞的能源，也是多糖的亚基 51

2.2.4脂肪酸是细胞膜的组分 53

2.2.5氨基酸是蛋白质的基本构成单位 54

2.2.6核苷酸是DNA及RNA的亚基 55

2.3细胞内的大分子 57

2.3.1大分子的亚基排列具有特定的序列 58

我们如何得知：什么是大分子？ 59

2.3.2非共价键确定一个大分子的精确形状 61

2.3.3非共价键使一个大分子结合另一些特定的分子 61

图版2-1化学键和化学基团 62

图版2-2水的化学性质 64

图版2-3几种糖的类型概述 66

图版2-4脂肪酸和其他脂类 68

图版2-5蛋白质里的20种氨基酸 70

图版2-6核苷酸概述 72

图版2-7非共价键的主要类型 74

3能量、催化作用与生物合成 82

3.1细胞中能量的利用 82

3.1.1细胞释放热能，从而有可能形成生物学有序性 82

3.1.2光合生物利用太阳光合成有机分子 84

3.1.3细胞通过有机分子的氧化作用获得能量 86

3.1.4氧化及还原反应涉及电子转移 87

3.2自由能和催化作用 89

3.2.1酶降低阻止化学反应的势垒 89

3.2.2一个反应的自由能变化决定这个反应能否进行 92

3.2.3反应物的浓度影响自由能的改变和反应的方向 92

3.2.4标准自由能的变化使得我们能比较不同反应之间的能量 93

3.2.5细胞生存于化学不平衡的状态下 93

3.2.6平衡常数直接与△G°成比例 94

3.2.7在复杂反应中，平衡常数取决于所有反应物和产物的浓度 95

3.2.8平衡常数指示分子相互作用的强度 95

3.2.9对于系列反应，自由能的变化是额外的 96

3.2.10酶如何找到它们的底物：快速扩散的重要性 98

3.2.11 Vax和KM计量酶的活性 99

我们如何得知：使用动力学来模拟和操作代谢途径 100

3.3活化的载体分子与生物合成 103

3.3.1一个活化载体的形成与一个能量方面有利的反应相耦合 104

3.3.2 ATP是用得最广泛的活化载体分子 104

3.3.3储存在ATP中的能量常被用于两个分子的连接 106

3.3.4 NADH及NADPH是重要的电子载体 106

3.3.5细胞内有许多其他活化载体分子 109

3.3.6生物多聚物的合成要求输人能量 111

图版3-1自由能与生物学反应 114

4蛋白质的结构和功能 122

4.1蛋白质的形状与结构 122

4.1.1氨基酸序列确定蛋白质的形状 122

4.1.2蛋白质折叠形成能量最低的构象 124

4.1.3蛋白质可以形成多种复杂的形状 126

4.1.4α螺旋和β折叠是常见的折叠方式 128

4.1.5在生物结构中容易形成螺旋结构 128

4.1.6在许多蛋白质的核心区域，β折叠形成坚固的结构 130

4.1.7蛋白质具有多个层次的组织形式 132

4.1.8在大量可能的多肽链中只有少数几个是有功能的 134

4.1.9蛋白质可被归纳分类 134

4.1.10大蛋白质分子通常含有一条以上的多肽链 134

4.1.11蛋白质可以装配形成丝、片或球 136

4.1.12一些类型的蛋白质具有伸长的纤维形状 137

4.1.13胞外蛋白常因共价交联而得以稳定 138

4.2蛋白质如何发挥作用 139

4.2.1蛋白质结合其他分子 139

4.2.2抗体结合位点极为多样化 141

4.2.3酶是强有力且高度专一的催化剂 142

4.2.4溶菌酶揭示了酶的工作机制 142

4.2.5大多数的药物抑制酶的活性 145

4.2.6紧密结合的小分子赋予蛋白质额外的功能 145

4.3蛋白质如何被调控 146

4.3.1酶的催化活性通常可以被其他分子调控 146

4.3.2变构酶有两个相互影响的结合位点 147

4.3.3磷酸化通过引发构象变化来调控蛋白质的活性 149

4.3.4 GTP结合蛋白同样受到添加和去除磷酸基团的调控 150

4.3.5核苷酸的水解促使细胞中的马达蛋白产生大的位移 151

4.3.6蛋白质通常形成大型复合物，起蛋白质机器的作用 151

4.3.7共价修饰调控蛋白质机器的定位和装配 153

我们如何得知：探究蛋白质的结构 154

4.4如何研究蛋白质 156

4.4.1细胞能够在培养皿上生长 157

4.4.2纯化技术使人们从细胞匀浆中获得均质的蛋白质制品 158

4.4.3通过基因工程技术能够大量生产几乎任何一种蛋白质 159

4.4.4蛋白质结构和功能的自动化研究加快了发现的步伐 160

图版4-1蛋白质功能的几个例子 161

图版4-2描述小型SH2蛋白结构域的四种不同方式 162

图版4-3抗体的制备和使用 164

图版4-4细胞的裂解和细胞抽提物的初步分离 166

图版4-5用层析法分离蛋白质 168

图版4-6用电泳法分离蛋白质 169

5 DNA和染色体 174

5.1 DNA的结构和功能 174

5.1.1一个DNA分子是由两条互补的核苷酸链组成的 175

我们如何得知：基因由DNA组成 176

5.1.2 DNA的结构提供了一种遗传机制 180

5.2真核生物染色体的结构 181

5.2.1真核生物的DNA包装在多个染色体中 181

5.2.2染色体含有一长串基因 183

5.2.3细胞周期中染色体以不同状态存在 184

5.2.4间期染色体是在细胞核内形成的 185

5.2.5染色体DNA是高度浓缩的 186

5.2.6核小体是染色质结构的基本单位 187

5.2.7染色体包装有多重层次 189

5.3染色体结构的调节 191

5.3.1染色体结构的改变使蛋白质可以接触DNA 191

5.3.2间期染色体同时含有浓缩的和伸展的染色质形态 192

5.3.3染色质结构的改变是可以遗传的 194

6 DNA复制、修复和重组 201

6.1 DNA复制 201

6.1.1碱基配对使DNA得以复制 201

6.1.2 DNA合成从复制起始位点开始 202

我们如何得知：复制的性质 203

6.1.3新的DNA在复制叉上进行合成 206

6.1.4复制叉是不对称的 207

6.1.5 DNA聚合酶能自我校正 208

6.1.6短的RNA充当DNA合成的引物 210

6.1.7在复制叉处的蛋白质相互协调，形成复制机器 212

6.1.8端粒酶复制真核生物染色体末端 213

6.2 DNA修复 214

6.2.1突变能对一个细胞或生物体产生严重的后果 214

6.2.2 DNA错配修复系统清除被复制机器忽略了的复制差错 215

6.2.3 DNA在细胞内持续不断地受到损伤 217

6.2.4基因的稳定性取决于DNA修复 218

6.2.5双链断裂可以被快速但并不完美地修复 220

6.2.6 DNA复制和修复的保真度的记录保存在基因组序列中 220

6.3同源重组 221

6.3.1同源重组需要有相似序列的大范围区域 221

6.3.2同源重组可以完美地修复DNA双链的断裂 221

6.3.3同源重组在减数分裂期间交换遗传信息 222

6.4可移动的遗传因子和病毒 224

6.4.1可移动的遗传因子编码其移动所需的组件 224

6.4.2人基因组由两个主要的转座序列家族组成 225

6.4.3病毒是能离开细胞的高度可移动的遗传因子 226

6.4.4逆转录病毒逆转正常的遗传信息流 228

7从DNA到蛋白质：细胞如何阅读基因组 234

7.1从DNA到RNA 234

7.1.1部分DNA序列转录成RNA 234

7.1.2转录产生与一条DNA链互补的RNA 235

7.1.3细胞内产生几种类型RNA 238

7.1.4 DNA上的信号指示RNA聚合酶在何处起始和结束 238

7.1.5真核生物基因转录的起始是一个复杂的过程 240

7.1.6真核RNA聚合酶需要通用转录因子 241

7.1.7真核RNA在核内同时被转录和加工 242

7.1.8真核基因被非编码序列所间隔 245

7.1.9内含子由RNA剪接而被去除 245

7.1.10成熟的真核细胞mRNA从细胞核内输出是具有选择性的 247

7.1.11 mRNA分子最终被细胞降解 247

7.1.12最早期的细胞基因内可能已有内含子 248

7.2从RNA到蛋白质 249

7.2.1 mRNA以三核苷酸组的形式被解译 249

我们如何得知：破译遗传密码 251

7.2.2 tRNA分子使氨基酸与mRNA上的密码子相匹配 253

7.2.3特定的酶使tRNA与正确的氮基酸偶联 254

7.2.4 RNA信息在核糖体上被解译 254

7.2.5核糖体具有催化功能 257

7.2.6 mRNA上的密码子指示蛋白质合成的起始及终止 258

7.2.7蛋白质在多核糖体上合成 260

7.2.8抗生素——原核生物的蛋白质合成抑制剂 260

7.2.9精细控制的蛋白质降解协助调控细胞内每种蛋白质的量 261

7.2.10从DNA到蛋白质之间有很多步骤 262

7.3 RNA和生命起源 263

7.3.1生命需要自催化 264

7.3.2 RNA既能储存信息也能催化化学反应 264

7.3.3 RNA在进化上早于DNA 265

8基因表达调控 272

8.1基因表达概述 272

8.1.1多细胞生物中的不同类型细胞包含相同的DNA 272

8.1.2不同细胞类型产生不同的蛋白质 273

8.1.3细胞可以响应外界信号改变自身基因的表达 273

8.1.4基因表达可在自DNA到RNA再到蛋白质途径中的多处步骤上被调控 273

8.2转录是如何开启的 274

8.2.1转录控制是通过蛋白质结合到DNA调节序列上实现的 274

8.2.2转录开关使细胞响应环境的改变 276

8.2.3阻抑物关闭基因，活化物开启它们 277

8.2.4活化物和阻抑物控制Lac操纵子 278

8.2.5真核基因转录调控蛋白从远处控制基因表达 279

8.2.6启动子DNA包装成核小体会影响转录起始 280

8.3造成特异细胞类型的分子机制 281

8.3.1真核基因是由蛋白质组合来调控的 281

我们如何得知：基因调控——Eve的故事 282

8.3.2不同基因的表达可被单个蛋白质协调 284

8.3.3组合控制可产生不同细胞类型 285

8.3.4稳定的基因表达型式可传递给子细胞 286

8.3.5单个转录调控蛋白能触发一个完整器官的生成 288

8.4转录后调控 289

8.4.1核开关给基因调控提供了一个经济的手段 289

8.4.2 mRNA的非翻译区域可以控制自身的翻译 289

8.4.3调控性小RNA可以控制成百上千动植物的基因的表达 291

8.4.4RNA干扰摧毁外源双链RNA 292

8.4.5科学家可以利用RNA干扰关闭基因 292

9基因和基因组如何进化 297

9.1遗传性变异的产生 297

9.1.1有性生殖生物体生殖细胞所产生的变异可以传递给后代 299

9.1.2 DNA复制和维护的正常机制发生故障将导致点突变的发生 300

9.1.3点突变能够改变对基因的调节 300

9.1.4 DNA复制产生相关基因家族 301

9.1.5珠蛋白的进化史显示了基因的复制和分离能够为生物体及其发展量身定制合适的蛋白质 304

9.1.6全基因组重复塑造了很多物种的进化史 305

9.1.7新的基因可通过同一外显子的重复而产生 305

9.1.8转座因子的移动加速了基因组进化 306

9.1.9基因的水平转移能够导致物种间基因交换 308

9.2重建生命的“家族树” 308

9.2.1具有选择性优势的遗传变异易于被保留 309

9.2.2人类和黑猩猩在基因组构成及序列细节上都具有相似性 310

9.2.3功能上重要的区域以保守DNA序列岛的形式出现 310

9.2.4基因组比较显示脊椎动物的基因组能够很快地获得和失去DNA 312

9.2.5序列保守性使得我们能够追溯最远的进化上的亲缘关系 313

9.3人类基因组的研究 314

9.3.1人类基因组的核苷酸序列显示我们的基因是如何编排的 315

我们如何得知：基因数目 317

9.3.2保守基因组序列的加速改变帮助我们揭示我们之所以为人类 319

9.3.3人类基因组的遗传变异有利于我们的个性发展 320

9.3.4人类基因组包含的丰富信息尚未被破译 321

10基因及基因组分析 327

10.1操纵及分析DNA分子 327

10.1.1限制性核酸酶在特定位点切开DNA分子 328

10.1.2凝胶电泳分离片段大小不同的DNA分子 329

10.1.3杂交为检测特定核苷酸序列提供了灵敏的方法 330

10.1.4杂交是通过设计识别特异核苷酸序列的DNA探针来完成的 330

10.2 DNA克隆技术 331

10.2.1 DNA连接酶将DNA片段连接成一个重组DNA分子 332

10.2.2重组DNA分子可以在细菌中进行复制 332

10.2.3特定的质粒载体被用来克隆DNA 333

10.2.4基因可以从DNA文库中分离得到 334

10.2.5 cDNA文库代表一个特定组织所产生的mRNA 336

10.2.6聚合酶链反应扩增选定的DNA序列 338

10.3探索解密遗传信息 342

10.3.1 DNA快速测序方法 343

10.3.2全新的DNA分子可以被构建出来 345

10.3.3应用重组DNA可以大量生产稀有蛋白质 345

我们如何得知：人类基因组测序 346

10.3.4报告基因及原位杂交可以揭示基因的表达的时空 349

10.3.5 DNA微阵列杂交可以一次性检测上千种基因的表达 352

10.3.6遗传学方法可以揭示基因功能 353

10.3.7动物可以进行遗传改造 353

10.3.8 RNA干扰为研究基因功能提供了简单的方法 356

10.3.9转基因植物对细胞生物学及农业十分重要 357

11膜的结构 366

11.1脂双层 366

11.1.1膜脂质在水中形成双层 366

11.1.2脂双层是一种二维流体 369

11.1.3脂双层的流动性取决于它的组成成分 371

11.1.4脂双层是不对称的 372

11.1.5在膜运输过程中脂质保留不对称性 372

11.2膜蛋白 373

11.2.1膜蛋白以多种方式与脂双层结合 374

11.2.2多肽链通常以α螺旋穿过双层 374

11.2.3膜蛋白能被去垢剂溶解并纯化 376

11.2.4只有少数几种膜蛋白的完整结构是清楚的 377

11.2.5细胞皮层加固质膜 378

11.2.6细胞能限制膜蛋白的运动 380

11.2.7细胞表面被覆糖类 381

我们如何得知：测量膜流 382

12膜转运 389

12.1膜转运的基本原理 389

12.1.1细胞内外的离子浓度差异很大 389

12.1.2脂质双分子层对于溶质和离子是不可渗透的 389

12.1.3膜转运蛋白分为两种类型：载体蛋白和通道蛋白 390

12.1.4溶质通过被动转运或主动转运穿过膜 391

12.2载体蛋白及其功能 391

12.2.1浓度梯度和电势能驱动被动转运 392

12.2.2主动转运使溶质逆它们的电化学梯度迁移 393

12.2.3动物细胞利用ATP水解的能量泵出Na+ 394

12.2.4 Na+-K+泵由瞬时磷酸化所驱动 395

12.2.5 Na+-K+泵帮助维持动物细胞的渗透压平衡 395

12.2.6 Ca2+泵使细胞内Ca2+保持低浓度 397

12.2.7偶联转运蛋白利用溶质浓度梯度主动摄取营养物 397

12.2.8植物、真菌和细菌利用H+梯度驱动膜转运 399

12.3离子通道和膜电位 401

12.3.1离子通道是离子选择性的和门控的 401

12.3.2离子通道在开放和关闭状态之间随机进行快速切换 403

12.3.3离子通道的开放和关闭受外界刺激影响 405

12.3.4电压门控离子通道应答膜电位 406

12.3.5膜电位由膜对特定离子的通透性来调控 406

12.4神经细胞的离子通道和信号转导 408

12.4.1动作电位为迅速的长距离通讯提供了条件 409

12.4.2动作电位通常由电压门控Na+通道介导 409

我们如何得知：乌贼为我们展示膜兴奋性的奥秘 411

12.4.3在神经末梢处，电压门控Ca2+通道把电信号转换为化学信号 414

12.4.4靶细胞内的递质门控通道把化学信号转变回电信号 415

12.4.5神经元既接收兴奋性输入又接收抑制性输入 416

12.4.6递质门控离子通道是精神药物的重要靶点 417

12.4.7突触连接使你能思考、动作和记忆 418

13细胞如何从食物中获得能量 423

13.1糖和脂肪的分解及利用 423

13.1.1食物分子分三个阶段分解 424

13.1.2糖酵解是一条重要的ATP生产途径 426

13.1.3发酵使ATP在无氧条件下产生 427

13.1.4糖酵解说明酶如何将氧化作用与能量储存耦合 427

13.1.5糖与脂肪都在线粒体中分解为乙酰CoA 431

13.1.6柠檬酸循环通过将乙酰基氧化为CO2而产生NADH 432

我们如何得知：发现柠檬酸循环 435

13.1.7许多生物合成途径从糖酵解或柠檬酸循环开始 437

13.1.8在大多数细胞中电子传递驱动大部分ATP合成 437

13.2代谢的调节 439

13.2.1合成代谢和分解代谢反应是有组织并受调控的 440

13.2.2反馈调节使细胞从葡萄糖降解变为葡萄糖合成 440

13.2.3细胞在特殊的存储器中储存食物分子以备需要 441

图版13-1详解糖酵解的10个步骤 444

图版13-2完整的柠檬酸循环 446

14线粒体和叶绿体中的能量生产 450

细胞通过一种基于膜的机制获得其大部分能量 450

14.1线粒体和氧化磷酸化 452

14.1.1线粒体由外膜、内膜以及两个膜被区室构成 453

14.1.2高能电子通过柠檬酸循环产生 454

14.1.3化学渗透过程将活化载体分子携带的能量转化为ATP 454

14.1.4电子传递链将质子泵入线粒体内膜 456

14.1.5泵送质子产生陡峭的跨线粒体内膜的电化学质子浓度梯度 456

14.1.6电化学质子梯度驱动ATP合成 458

14.1.7电化学质子梯度驱动跨线粒体内膜的偶联转运 459

14.1.8氧化磷酸化产生细胞的大部分ATP 460

14.1.9在线粒体内ADPP快速转变成ATP，使细胞内维持ATP/ADP的高比率 461

14.2电子传递与质子泵送的分子机制 461

14.2.1质子很容易被电子传递移动 461

14.2.2氧化还原电位是电子亲和性的量度 462

我们如何得知：化学渗透偶联如何驱动ATP合成 463

14.2.3电子传递释放大量能量 465

14.2.4金属紧密地与蛋白质结合，形成多种多样的电子载体 466

14.2.5细胞色素氧化酶催化分子氧的还原反应 468

14.2.6在原子水平研究H+泵送机制 469

14.2.7呼吸作用有惊入的效率 470

14.3叶绿体与光合作用 470

14.3.1叶绿体与线粒体相似但有一个额外的区室 471

14.3.2叶绿体从阳光捕获能量用以固定碳 473

14.3.3叶绿素分子吸收光能 473

14.3.4激活的叶绿素分子把能量汇集到一个反应中心 474

14.3.5光能驱动ATP和NADPH的合成 476

14.3.6叶绿体能够调节自身的ATP合成 477

14.3.7使用ATP和NADPH进行碳固定以将CO2转化为糖 478

14.3.8碳固定作用产生的糖可以以淀粉形式储存或消耗用以产生ATP 480

14.4线粒体和叶绿体的起源 480

14.4.1氧化磷酸化可能为古细菌提供了进化优势 481

14.4.2光合成细菌对它们的环境需求更少 482

14.4.3甲烷球菌的生命形式表明化学渗透偶联是一个古老的过程 484

图版14-1氧化还原电位 485

15胞内区室及转运 490

15.1膜被细胞器 490

15.1.1真核细胞含有一套基本的膜被细胞器 491

15.1.2膜被细胞器由不同途径进化而来 493

15.2蛋白质分选 494

15.2.1蛋白质通过三种机制输入细胞器 495

15.2.2信号序列指导蛋白质到正确的区室中 495

15.2.3蛋白质通过核孔进入核内 496

15.2.4蛋白质解折叠进入线粒体和叶绿体 498

15.2.5蛋白质在被合成时即进入内质网 499

15.2.6可溶性蛋白质被释入内质网腔 501

15.2.7起始和终止信号决定跨膜蛋白在脂双层中的排列 502

15.3囊泡转运 504

15.3.1转运囊泡携带可溶性蛋白质和膜来往于区室之间 504

15.3.2囊泡出芽由一种蛋白质外被的组装所驱动 505

15.3.3束缚蛋白和SNARE决定囊泡停靠的特定地点 506

15.4分泌途径 508

15.4.1大多数蛋白质在内质网中被共价修饰 508

15.4.2蛋白质离开内质网时受到监控以保证蛋白质的质量 508

15.4.3内质网的大小由流经它的蛋白质的数量决定 510

15.4.4蛋白质在高尔基体内被进一步修饰和分选 510

15.4.5分泌蛋白通过胞吐作用自细胞中释出 511

15.5胞吞途径 513

我们如何得知：追踪蛋白质和囊泡运输 513

15.5.1特化的吞噬细胞摄入大颗粒 515

15.5.2液体和大分子通过胞饮作用被摄入 516

15.5.3受体介导的胞吞作用提供一条进入动物细胞的特殊途径 516

15.5.4胞吞的大分子在内体中被分选 517

15.5.5溶酶体是细胞内消化的主要场所 518

16细胞通讯 525

16.1细胞信号传导的一般原理 525

16.1.1信号能经过长程或短程而起作用 525

16.1.2每个细胞根据其自身来源和现状应答有限的一组信号 528

16.1.3细胞对信号的响应可快可慢 529

16.1.4有些激素穿越质膜并且结合到胞内受体上 530

16.1.5一些可溶性气体穿越质膜，直接激活细胞内的酶 531

16.1.6细胞表面受体经由胞内信号传导途径传递胞外信号 532

16.1.7一些细胞内信号传导蛋白起分子开关的作用 534

16.1.8细胞表面受体分为三个主要的类别 535

16.1.9与离子通道偶联的受体把化学信号转变成电信号 537

16.2 G蛋白偶联受体 537

16.2.1 G蛋白偶联受体的刺激作用激活G蛋白亚基 537

16.2.2某些G蛋白直接调节离子通道 540

16.2.3某些G蛋白激活与膜结合的酶 540

16.2.4 cAMP通路可激活酶并开启基因 541

16.2.5肌醇磷脂途径引起细胞内Ca2+升高 544

16.2.6 Ca2-信号触发诸多生物学过程 546

16.2.7细胞内信号级联放大能达到惊人的速度、敏感性和适应性 546

16.3酶联受体 549

16.3.1激活的受体酪氨酸激酶招募一个胞内信号蛋白复合物 549

16.3.2大多数受体酪氨酸激酶激活单体GTP酶Ras 550

16.3.3受体酪氨酸激酶激活磷酸肌醇3激酶产生质膜中的脂停泊位点 551

我们如何得知：解析细胞信号通路 553

16.3.4有些受体激活一条到核的快速通道 556

16.3.5多细胞性和细胞通讯在植物和动物中独立地进化 558

16.3.6蛋白激酶网络整合信息来控制复杂的细胞行为 558

17细胞骨架 566

17.1中间丝 566

17.1.1坚固耐久的中间丝 566

17.1.2中间丝增强细胞应对机械压力 567

17.1.3核被膜由中间丝构成的纤维网络支撑 569

17.2微管 570

17.2.1微管是两端结构明显不同的中空管子 571

17.2.2中心体是动物细胞中主要的微管组织中心 571

17.2.3增长中的微管表现出动态的不稳定性 572

17.2.4微管被维持在组装和去组装的动态平衡中 573

17.2.5微管把细胞的内部组织起来 575

17.2.6马达蛋白驱动胞内转运 575

17.2.7细胞器沿着微管移动 577

我们如何得知：寻找马达蛋白 578

17.2.8动力蛋白驱动含有稳定微管的纤毛和鞭毛 580

17.3肌动蛋白丝 583

17.3.1肌动蛋白丝纤细而富有柔韧性 583

17.3.2肌动蛋白和微管蛋白通过相同的机制聚合起来 583

17.3.3许多蛋白质结合肌动蛋白丝并修饰其性能 584

17.3.4大部分真核细胞质膜下有一个富含肌动蛋白的“皮层” 585

17.3.5细胞的爬行依赖于肌动蛋白 586

17.3.6肌动蛋白结合肌球蛋白并形成可收缩的结构 588

17.3.7胞外信号控制肌动蛋白丝的排列 589

17.4肌肉收缩 590

17.4.1肌肉收缩依赖于肌动蛋白和肌球蛋白的纤维束 590

17.4.2在肌肉收缩中，肌动蛋白丝和肌球蛋白丝相互滑动 590

17.4.3突发性Ca2+升高触发肌肉收缩 592

17.4.4在机体中肌细胞发挥高度特化的功能 595

图版17-1三种蛋白丝的主要类型 596

18细胞分裂周期概述 601

18.1细胞分裂周期 601

18.1.1细胞周期概述 602

18.1.2真核细胞周期可分为四期 602

18.1.3一个中央控制系统启动细胞周期的主要进程 603

18.1.4细胞周期控制在所有真核细胞中都是类似的 604

18.2细胞周期控制系统 604

18.2.1细胞周期控制系统依赖于周期性激活的蛋白激酶（称为Cdk） 605

我们如何得知：细胞周期蛋白和Cdk的发现 605

18.2.2 Cdk的活性也受磷酸化和去磷酸化所调节 607

18.2.3各种细胞周期蛋白—Cdk复合物启动细胞周期的不同步骤 607

18.2.4细胞周期控制系统同样依赖于细胞周期蛋白 609

18.2.5抑制Cdk的蛋白可以使细胞周期停滞在特定的检查点 609

18.3 S期 610

18.3.1 S-Cdk启动DNA复制并有助于预防再复制 610

18.3.2黏连蛋白保持每个复制染色体的姐妹染色单体在一起 611

18.3.3 DNA损伤检查点有助于防止受损DNA的复制 611

18.4 M期 613

18.4.1 M-Cdk促使进入M期和有丝分裂 613

18.4.2凝缩蛋白帮助复制的染色体成型以便分离 614

18.4.3细胞骨架实现了有丝分裂和胞质分裂 614

18.4.4 M期通常分为六个阶段 615

18.5有丝分裂 615

18.5.1两个中心体有助于形成有丝分裂纺锤体的两极 616

18.5.2有丝分裂纺锤体在前期开始组装 617

18.5.3染色体在前中期附着于有丝分裂纺锤体 617

18.5.4染色体辅助装配有丝分裂纺锤体 619

18.5.5中期染色体排列在纺锤体的赤道板处 619

18.5.6蛋白质水解引发姐妹染色单体分离并完成有丝分裂 620

18.5.7染色体在后期分开 620

18.5.8未连接的染色体阻止姐妹染色单体分离 622

18.5.9核被膜在分裂末期重新形成 622

18.6胞质分裂 623

18.6.1有丝分裂纺锤体决定胞质分裂面 623

18.6.2动物细胞的收缩环由肌动蛋白和肌球蛋白构成 623

18.6.3植物细胞中胞质分裂涉及新细胞壁的形成 624

18.6.4细胞分裂时的被膜细胞器必须分配到子细胞中 625

18.7细胞数量和细胞大小的控制 626

18.7.1凋亡辅助调节动物细胞数目 626

18.7.2胞内的蛋白质水解级联反应介导细胞凋亡 627

18.7.3胞内蛋白Bcl2家族调控细胞死亡程序 628

18.7.4动物细胞需要胞外信号来进行生存、生长和分裂 629

18.7.5动物细胞需要存活因子以免于凋亡 630

18.7.6促有丝分裂因子促进细胞分裂 631

18.7.7生长因子刺激细胞生长 632

18.7.8一些胞外信号蛋白抑制细胞存活、细胞分裂或细胞生长 632

图版18—1动物细胞M期的主要阶段 634

19性与遗传 641

19.1性的优势 641

19.1.1有性生殖需要二倍体和单倍体两种细胞 642

19.1.2有性生殖使生物体具有竞争优势 644

19.2减数分裂及受精作用 645

19.2.1二倍体细胞通过减数分裂产生单倍体细胞 645

19.2.2减数分裂涉及特殊的染色体配对过程 646

19.2.3同源染色体间可以进行交换 647

19.2.4染色体配对和重组保障同源染色体的分离 648

19.2.5第二次减数分裂产生单倍体子代细胞 649

19.2.6单倍体细胞的遗传信息进行了重组 649

19.2.7减数分裂并非完美无缺 651

19.2.8受精重新建成新的二倍体基因组 652

19.3孟德尔和遗传法则 653

19.3.1孟德尔选择以分离方式遗传的性状来研究 654

19.3.2孟德尔否认了其他的遗传理论 655

19.3.3孟德尔第一次揭示了遗传分离定律 655

19.3.4每个配子对应于每一种性状含有一个等位基因 656

19.3.5孟德尔的分离定律适用于所有的有性生殖生物 657

19.3.6决定不同性状的等位基因间独立分离 658

19.3.7减数分裂时孟德尔遗传法则下的染色体行为 660

19.3.8染色体交换可以用于测定基因的距离 660

19.3.9突变可以导致基因功能的丧失或获得 662

19.3.10每个人都携带很多潜在的隐性的有害突变 662

19.4遗传学作为实验工具 663

19.4.1经典的方法始于随机突变 663

19.4.2遗传筛选鉴定造成专一性细胞学过程缺陷的突变 664

19.4.3互补实验检测两个突变是否在同一个基因上 665

19.4.4单碱基多态性（SNP）作为遗传图谱的标记 665

我们如何得知：利用SNP揭开人类疾病的面纱 667

19.4.5连锁的SNP组成单倍型域 669

19.4.6单倍型域为我们了解自己的进化历史提供了线索 670

图版19-1经典遗传学的要义 672

20细胞群落：组织、干细胞和癌 678

20.1胞外基质与结缔组织 678

20.1.1植物细胞具有坚韧的细胞外壁 679

20.1.2纤维素纤维使植物细胞具有抗拉强度 679

20.1.3动物的结缔组织主要由胞外基质组成 681

20.1.4胶原蛋白使动物结缔组织具有抗拉强度 682

20.1.5细胞分泌胶原蛋白并组织其分布 684

20.1.6整联蛋白使细胞外的基质与细胞内的细胞骨架偶合 685

20.1.7多糖和蛋白质凝胶填充间隙并抗压 686

20.2上皮层和胞间连接 687

20.2.1上皮层是极化的并位于基板上 688

20.2.2紧密连接使上皮不渗透并且隔离其顶端表面和基部表面 689

20.2.3与细胞骨架相连的细胞连接坚固地把上皮细胞和上皮细胞以及上皮细胞和基板结合起来 691

20.2.4间隙连接使离子和小分子能在细胞之间穿行 694

20.3组织的维持和更新 695

20.3.1组织是多种细胞类型有规律的混合物 696

20.3.2不同的组织更新的速度也不同 698

20.3.3三干细胞持续供应终末分化的细胞 699

20.3.4特殊信号维持干细胞群体的数量 701

20.3.5干细胞可以修复受损的组织 702

20.3.6治疗性克隆提供了一条产生个体化ES细胞的途径 703

20.4癌症 704

20.4.1癌细胞的增殖、侵袭及转移 705

20.4.2流行病学研究显示癌症发生的可预防因素 706

20.4.3癌症通过突变的累积进行发展 706

20.4.4癌细胞进化形成一种能赋予它们竞争优势的特性 707

20.4.5基因类型多样化是癌症发生的关键 709

我们如何得知：搞清楚那些对癌症有关键性影响的基因 711

20.4.6肠癌显示基因的缺失如何引起肿瘤的生长 713

20.4.7癌细胞生物学的研究开辟了寻找癌症治疗新方法的途径 714

术语汇编 719

答案 742

索引 800