图书介绍
分子生物学 解析基因体学的变革pdf电子书版本下载
- 阙斌如中等译 著
- 出版社： 沧海书局
- ISBN：9866889467
- 出版时间：2007
- 标注页数：666页
- 文件大小：112MB
- 文件页数：683页
- 主题词：
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图书目录
CHAPTER 1基础遗传学 1
遗传学之父——孟德尔 2
基因决定生化途径的每一步 3
突变是来自於基因的改变 4
表现型与基因型 5
染色体为一含有基因的细长分子 6
不同的生物体具有不同数目的染色体 8
显性及隐性的对偶基因 10
部分显性、共同显性、穿透性及修饰基因 11
来自父母双方的基因由於有性生殖而产生混合 13
性别的决定与特性 16
在遗传时邻近基因是互相关联 17
减数分裂的重组是为了确保基因的多变性 18
大肠杆菌是研究细菌基因的模组 20
CHAPTER 2细胞与生物体 25
生命是什么？ 26
生命体由细胞组成 27
活细胞的主要特质 28
原核细胞缺少细胞核 31
真细菌和古细菌在基因上是不同的 32
细菌可用来做细胞功能的基础研究 33
大肠杆菌为细菌的主要系统 36
大自然中哪里可找到细菌？ 37
部分细菌引起感染性疾病，但大部分是有益的 38
真核细胞内部可分为数个区间 38
真核细胞的多变性 41
真核细胞具有两个基本细胞系统 41
生物体的分类 41
研究中广泛使用的生物体 45
酵母菌广泛用来研究单一真核细胞 45
线虫与果蝇用来研究多细胞动物 47
斑马鱼用来研究脊椎动物发育 48
老鼠与人类 49
阿拉伯芥可做为植物系统 50
单倍体、双倍体与真核细胞的细胞周期 50
病毒并非活细胞 51
细菌病毒感染细菌 53
常见的人类病毒疾病 53
多种亚细胞基因实体 55
CHAPTER 3 DNA、RNA和蛋白质 59
核酸分子带著基因讯息 60
核酸的化学结构 60
DNA和RNA各有四个硷基 62
核苷是由硷基与糖组成：核苷酸是由核苷加上磷酸而成 63
两条DNA形成双股螺旋 64
硷基配对的稳定利用氢键的形成 66
双股螺旋的互补性解释遗传学的迷思 69
染色体的组成 69
中心理论列出基因讯息的流向 72
核糖体判读基因密码 75
基因密码指示蛋白质的胺基酸序列 76
各种的RNA具有不同的功能 78
蛋白质由胺基酸组成来执行许多细胞的功能 80
蛋白质的结构有四种层级 81
蛋白质各具有不同的功能 83
CHAPTER 4基因、基因体与DNA 87
DNA为遗传物质的历史回溯 88
维持生命需要多少的基因讯息才足够 90
非编码DNA 90
非编码DNA序列中也可能存在编码DNA 93
重复序列的DNA是较高等生物的特性 94
卫星DNA是非编码DNA以重复序列出现 96
迷你卫星DNA与VNTR 97
自私DNA与垃圾DNA的起源 98
回文、倒转重复序列、茎状与环状结构 100
多个A-tracts造成DNA弯曲 102
超螺旋在细菌DNA的包装上是必要的 102
拓朴酶和DNA促旋酶 104
锁形与打结的DNA必须被校正 105
局部的超螺旋 105
超螺旋影响DNA的结构 107
DNA的另类螺旋结构 107
真核细胞的组蛋白包装DNA 110
真核细胞更进一步的DNA包装 112
高温使得DNA双股分开：冷却使它们结合 115
CHAPTER 5细胞分裂与DNA复制 121
细胞分裂和繁殖不一定相同 122
DNA复制发生在复制叉上，是一种两阶段的过程 123
超螺旋引起复制的问题 124
双股分离在DNA合成之前 126
DNA聚合酶的特性 127
核苷酸的聚合 128
供应DNA合成的前驱物质 128
DNA聚合酶延长DNA单股 130
复制叉是复杂的 133
DNA间断的合成需要一个引发体的蛋白复合体 134
延迟股的完成 136
染色体复制起始於oriC 137
DNA甲基化和附著到细胞膜可以控制复制初始 139
染色体复制结束在terC 141
松开子代染色体 142
在染色体复制后才发生细菌细胞分裂 143
细菌花了多少时间进行复制 143
复制子的概念 145
在真核细胞中复制直线状DNA 147
真核细胞染色体有多个的复制起始点 150
真核细胞DNA复制 150
高等生物体的细胞分裂 152
CHAPTER 6基因转录作用 155
基因藉由制造RNA而表现 156
染色体上的短片段可转变成遗传讯息 157
词汇：顺反子、编码序列、开放读取框架 158
基因的起始序列是如何被辨识的？ 159
遗传讯息的大量制造 161
RNA聚合酶知道应该在何处停止 163
细胞如何知道哪些基因需要被启动表现？ 167
启动子如何被活化？ 168
抑制子的作用导致了转录的负向调控作用 169
许多调控蛋白可与小分子结合并因此改变形状 170
真核生物的转录作用较为复杂 172
真核生物的rRNA与tRNA的转录作用 173
真核生物中带有蛋白质编码基因的转录作用 176
上游因子可增加RNA聚合酶Ⅱ的效能 179
增强子可从远端调控转录作用 181
CHAPTER 7蛋白质的结构与功能 183
胺基酸组成蛋白质 184
多胜性肽链的形成 184
二十种胺基酸组成多胜肽链 186
胺基酸拥有α碳的不对称性 188
蛋白质在有机体中有四种层级的结构 189
蛋白质藉由氢键形成二级结构 190
蛋白质的三级结构 193
维持蛋白质3-D结构的多种作用力 196
半胱胺酸形成双硫键 197
大分子蛋白质中的多摺叠功能区域 197
蛋白质的四级结构 199
较高程度的组装与自行组装 200
辅助因子和金属离子通常帮助相关的蛋白质 200
核酸蛋白、脂蛋白和糖蛋白都是复合蛋白质 204
蛋白质提供许多细胞功能 205
蛋白质机器 209
酵素催化代谢反应 209
酵素有多样的专一性 211
锁钥模型和诱使适合的模型描述酵素与受质的结合 213
酵素根据其受质来命名和分类 214
酵素可以降低活化能 215
酵素的反应速率 216
受质类似物和酵素抑制剂作用於酵素的活化区 217
酵素也可以直接被调节 219
异位酵素受讯息分子所影响 220
酵素藉由化学修饰来调控 223
蛋白质以多种不同的路径与去氧核糖核酸（DNA）结合 224
蛋白质的变性 228
CHAPTER 8蛋白质的合成 233
蛋白质的合成过程是有计画的执行 234
蛋白质为基因的产物 234
基因密码的解译 235
tRNA会扭转成三叶形，并摺叠成L型 236
存在於tRNA的修饰硷基 238
某些tRNA能识别超过一个以上的密码子 238
tRNA如何进行充电 240
核糖体：细胞的遗传讯息解码机 242
三种可能的读取框架 245
起始密码子的选择 246
起始复合物在转译前必须先行组合 248
tRNA在多肽链延长过程中在核糖体的三个结合位置 250
释放因子可终止蛋白质合成 251
数个核糖体可以同时读取同一条mRNA上面的遗传讯息 252
细菌的单一mRNA分子即可以编译数种蛋白质 253
细菌内的转录与转译作用是同时进行 254
转译过程中作用延滞的核糖体及状况的解除 255
真核细胞与原核细胞合成蛋白质的差异 256
真核细胞如何开始进行蛋白质合成 258
细胞能在当资源缺乏时暂停蛋白质的合成 258
被输出至细胞外的蛋白质具有一段特殊的讯号序列 261
伴侣素能监控蛋白质摺叠的正确性 262
粒线体与叶绿体内的蛋白质合成 264
转位酶负责将蛋白质运送至粒线体与叶绿体内 265
误译导致蛋白质的合成错误 266
基因密码并非总是通用 266
罕见胺基酸透过转译后修饰机制产生 267
硒胺酸：第21种胺基酸 268
吡咯赖胺酸：第22个胺基酸 269
多数的抗生素的作用是透过抑制蛋白质合成 270
蛋白质的降解 271
CHAPTER 9原核生物转录的调控 277
基因调控确认生理反应 278
转录层次的调控涉及数个步骤 279
原核生物替代的sigma因子辨识不同的基因组 281
原核生物的热休克sigma因子受温度调节 282
杆菌孢子形成时发生的替代sigma因子阶梯 284
抗-sigma因子使sigma不活化：抗-抗-sigma因子释放sigma使它能发挥作用 286
活化子与抑制子参与正向及负向调控 287
基因调控的操作组模型 288
某些蛋白质可以同时做为抑制子及活化子 291
讯号分子的性质 294
活化子与抑制子可以被共价性地修饰 296
二元调节系统 297
磷酸重置系统（Phosphorelay Systems） 299
特异的与全面的调节 300
Crp蛋白质是全面性调控蛋白的一个例子 300
附属因子与拟核结合蛋白质 301
在远处的作用与DNA套环化 303
抗-终止做为一种调控机制 304
CHAPTER 10真核细胞转录的调控 309
真核细胞转录的调控远比原核细胞的调控复杂 310
特定的转录因子可调控能转译成蛋白质的基因 311
中介子复合物可将讯息传递到RNA聚合酶 311
增强子与绝缘子序列将不同功能的DNA区隔开 312
矩阵的连结部位允许DNA形成环状 315
真核细胞具有转录的负向调控 315
异染色质使得真核细胞DNA难以被接近 317
真核细胞的DNA甲基化可调控基因表现 321
基因的静默可由DNA甲基化而引起 323
真核细胞基因的印痕以DNA甲基化为基础 324
X-染色体的不活化发生在雌性××动物 326
CHAPTER 11 RNA层次上的调控 331
RNA层次上的调控 332
蛋白质结合mRNA控制其分解速率 332
某些mRNA分子在转译前必须先切割 333
某些调控蛋白可以导致转译抑制 335
某些调控蛋白可以导致转译活化 337
转译可以受到反义RNA调控 339
核糖体改变进行转译调控 341
RNA干扰（RNAi） 342
RNA干扰的放大及扩散 344
实验中使用小片段干扰RNA （siRNA） 345
植物的后转录基因静默与真菌的基因压制作用 346
微小RNA：一类小型调控RNA 347
前驱物终止作用导致RNA转录的衰减作用 349
核糖开关——RNA可以直接做为调控机制 351
CHAPTER 12核糖核酸（RNA）的修饰 355
核糖核酸（RNA）产生过程需经过数种修饰 356
编码及非编码之RNA 357
核糖体核糖核酸（rRNA）及转运核糖核酸（tRNA）之产生过程 358
真核细胞讯息核糖核酸（mRNA）包含一帽盖及一尾部 359
成帽反应为讯息核糖核酸（mRNA）成熟之第一步骤 360
多重聚腺嘌吟尾（poly（A） tail）会被加在真核细胞讯息核糖核酸（mRNA） 362
内含子会经由剪接过程由RNA中移除 363
不同类型的内含子有不同的剪接机制 367
选择性剪接可产生多种形式的RNA 370
内蛋白子及蛋白质的剪接 373
核糖体核糖核酸（rRNA）硷基的修饰需要导引核糖核酸（guide RNA） 378
RNA的编辑包含了硷基序列的改变 379
RNA需由细胞核转运出 383
讯息核糖核酸（mRNA）的降解 384
无意义序列的存在能中介讯息核糖核酸（mRNA）的衰退 386
CHAPTER 13突变 391
改变DNA序列的突变 392
突变的主要分类 393
硷基替换的突变 394
误义突变的影响可大可小 395
无义突变会使胜肽链提早终止 398
删除突变会造成蛋白质变短或消失 399
插入突变常会干扰原有基因 400
框架位移突变有时会造成不正常蛋白质 401
DNA的重排包含了倒转、移位及重复 402
相位变异是因为可回复的DNA变化所造成的 404
静默突变并不会改变表现型 406
化学致变剂会损害DNA 407
辐射会造成突变 410
自发突变可能是由於DNA聚合酶的错误所造成的 411
突变可能是因为配对错误及重组所造成 412
自发突变可能是互变异构作用的结果 413
自发突变可能是由於遗传的化学不稳定性所造成 415
突变发生在热点的频率更高 418
突变有多常发生？ 418
回复突变是使表现型回复成野生型的遗传基因改变 420
回复突变可因其他基因的补偿性改变而发生 422
转移RNA所造成的解码改变可能会造成抑制 423
致变性化合物可以经由回复突变来侦测 425
突变株分离实验 426
生体外与生体内致突变作用 427
定点突变 429
CHAPTER 14重组与修复 433
重组作用总览 434
同源重组的分子机制 435
单股入侵及chi位 438
位置专一性重组 439
高等生物的重组作用 443
DNA修复总览 444
DNA的错误配对修复系统 445
一般切除修复系统 449
切除特定的硷基来修复DNA 450
特化的DNA修复机制 451
光活化作用切除胸腺嘧啶二元体 453
伴随转录的修复作用 454
重组作用的修复 456
细菌的SOS错误倾向修复 457
真核生物的修复 458
真核生物的双股修复 459
基因转换 461
CHAPTER 15移动DNA 465
细胞中的遗传因子可以被视为是基因生物 466
大部分的移动DNA是由转位因子所组成 466
转位子的必要组成 468
插入序列——最简单的转位子 469
藉由保留转位移动 471
复杂转位子藉由复制转位移动 472
保留转位及复制转位是相关的 475
复合转位子 478
转位可能会重排宿主DNA 479
较高等生物中的转位子 480
反转录因子会制造一个RNA复本 484
哺乳类动物中的重复DNA 486
宿主衍生DNA的反转录插入 487
反子转码产生细菌的反转录酶 487
各类转位因子 489
噬菌体Mu是转位子 491
接合转位子 491
嵌入子帮转位子收集基因 494
垃圾DNA与自私DNA 495
返巢内含子 496
CHAPTER 16质体 501
质体做为一个复制子 502
质体的一般特性 503
质体家族和不相容性 505
质体偶尔是直线状或是RNA的形式 505
质体DNA以两种不同的方法进行复制 507
以反股RNA对复本数的控制 510
质体瘾和寄主杀害作用 511
许多质体帮助它们的寄主细胞 514
抗-抗生素的质体 515
抗生素抗药性的机制 516
乙内醯胺（Beta-lactam）抗生素的抗药性 517
对氯霉素的抗药性 518
对胺基糖苷的抗药性 519
对四环霉素的抗药性 520
对磺胺和三甲氧二胺嘧啶的抗药性 521
质体可能提供侵略的特质 523
大部分大肠杆菌素以两种不同机制中的一种进行杀害作用 524
细菌对自己的大肠杆菌素产生免疫 525
大肠杆菌素的合成和释放 526
毒力质体 527
Ti质体可以从细菌转移到植物 528
酵母菌的2μ质体 531
某些DNA分子的行为像病毒或质体 532
CHAPTER 17病毒 535
病毒是一种具有遗传物质的传染性微生物 536
病毒的生活史 538
细菌病毒即所谓的「噬菌体」 541
潜溶期或潜伏期 543
各种病毒 544
小型的单股DNA细菌病毒 546
复杂的双股DNA细菌病毒 548
高等生物DNA病毒 549
RNA病毒基因体仅携带极少数的基因 550
细菌RNA病毒 552
动物双股RNA病毒 553
单股RNA病毒可合成「聚合蛋白质」 553
单股 RNA病毒的策略 554
植物RNA病毒 555
反转录病毒可灵活使用DNA和RNA 556
反转录病毒基因体 561
次级病毒传染物 561
卫星病毒 561
类病毒是一种具感染力的裸露RNA分子 564
普立子是一种具感染力的蛋白质 566
CHAPTER 18细菌遗传 571
繁殖与基因转移 572
外来DNA进入菌体后的结果 573
转型是由裸露的DNA片段进行转移 575
转型是DNA为遗传物质的证明 576
自然界中的转型 578
病毒的基因转移——转导 579
一般化的转导 580
特化的转导 581
细菌间质体的转移 583
染色体基因转移需要质体的插入 585
格兰氏阳性菌间的基因转移 588
古细菌的遗传 591
全基因体的定序 593
CHAPTER 19低等真核生物之多样性 597
真核生物起源於共生 598
粒线体与叶绿体的基因体 600
一级内共生与二级内共生 600
疟原虫是植物吗？ 603
共生：寄生及互利共生 605
杀手型草履虫的内共生菌 605
布赫纳氏菌是胞器还是细菌？ 607
纤毛虫有两种细胞核 608
锥体虫藉由改变其表面蛋白质来逃脱免疫系统的攻击 611
酵母菌交配型的决定 617
多细胞生物与同位序列基因 622
CHAPTER 20分子演化 627
源起——地球的形成 628
早期的大气 628
奥裴林生命起源假说 629
密勒实验 630
单分子形成聚合物的聚合作用 633
随机性类蛋白的酵素活性 634
生成巨分子的起源 635
Ribozymes和RNA世界 636
第一个细胞 639
代谢起源的自营学说 639
DNA、RNA和蛋白质序列的演化 641
藉由复制作用创造新基因 643
同种同源性和异种同源性序列 645
以改组（shuffling）创造新基因 646
不同的蛋白质以极相异的速度逐步演化 647
以分子时钟来追踪演化 649
核糖体RNA——缓慢发出滴答声的时钟 650
古细菌与真细菌互相抗衡 652
DNA定序和生物的分类 656
粒线体DNA——快速发出滴答声的时钟 657
非洲夏娃假说 658
来自绝种动物的古老DNA 661
侧面演化：平行基因转移 663
评估平行基因转移所遭遇的问题 664
CHAPTER 21核酸：分离、纯化、侦测与杂交 667
DNA的分离 668
DNA的纯化 668
去除不需要的RNA 669
DNA的胶体电泳 670
脉冲式胶体电泳 672
变性梯度胶体电泳 674
DNA的化学合成 675
完整基因的化学合成 680
胜性肽核酸 680
以紫外光测量DNA与RNA浓度 682
核酸的放射线标示 683
放射标示DNA的侦测 685
用萤光侦测DNA与RNA 686
以生物素或洋地黄素进行化学标定 688
电子显微镜 690
DNA与RNA的杂交 692
南方氏、北方氏、西方氏墨点法 695
动物园墨点法 696
萤光原位杂交 696
分子信标 699
CHAPTER 22重组DNA技术 701
绪论 702
核酸酶水解核糖核酸 702
限制与修饰DNA 702
限制内切酶辨识DNA 703
限制酶的命名 704
限制酶切割DNA 705
利用DNA接合酶连接DNA 707
制作限制酶图谱 707
限制酶片段长度多型性 710
选殖载体的特性 711
多重拷贝质体载体 713
将基因插入载体中 714
侦测插入载体的基因 715
在生物体之间移动的基因：穿梭载体 719
γ噬菌体载体 720
黏性载体 721
酵母菌人工染色体 722
细菌人工染色体 725
DNA库：收集某一特定生物的全部基因 725
以杂交反应筛选基因库 727
利用免疫的方法筛选基因库 728
选殖不含内含子的互补DNA 728
染色体游走 730
减去杂交法选殖 733
表现载体 735
CHAPTER23 聚合酶链反应 739
聚合酶链反应的基础 740
PCR循环的过程 743
退化的引子 745
反逆PCR 746
加入人工的限制酶切位 747
以PCR进行TA选殖 748
随机放大多型性 DNA （RAPD） 749
反转录酶PCR 751
差别表现PCR 752
cDNA末端的快速放大（RACE） 753
PCR应用在遗传工程 756
直接突变 756
藉PCR进行基因删除与插入 757
PCR应用在医学的诊断 758
藉PCR行环境的分析 760
藉PCR从灭绝的生命形式挽救DNA 761
即时萤光PCR 761
PCR——蠍引子应用在分子信标的内含物 763
绕圆的放大技术（RCAT） 766
CHAPTER 24基因体学与DNA定序 769
基因体学的介绍 770
DNA定序——一般性的法则 770
DNA定序之链终止方法 771
DNA聚合酶用於DNA定序 776
产生模板DNA用於定序 776
引子沿著DNA股移动 778
自动化定序 779
DNA晶片技术的出现 780
寡核苷酸晶片侦测器 781
焦磷酸定序 783
奈米通道DNA侦测仪 783
大规模序列标定图谱 786
序列标定位点图谱 787
用散弹枪定序组合成小的基因体 789
人类基因体竞赛 791
由大型的选殖连续体组合成基因体 792
由直接散弹枪定序组合成基因体 793
人类基因体调查 794
序列多型性：简单序列长度多型性与单一核苷酸多型性 797
使用外显子套取找出基因 799
生物资讯与电脑分析 801
CHAPTER 25基因表现分析 805
简介 806
监测基因表现 806
监测基因表现的报导基因 807
方便检测的酵素做为报导者 807
可释出光线的冷光酶当作报导系统 811
绿萤光蛋白做为报导者 812
基因接合 813
上游区域的删除分析 816
定位蛋白质键结的上游区域 816
藉由引子延伸方法定位转录起始位置 820
藉由S1核酸分解酶定位转录起始位置 821
转录体分析 822
DNA微阵列分析基因表现 824
基因表现连续分析 827
CHAPTER 26蛋白质体学：整体性的分析蛋白质 833
蛋白质体学简介 834
蛋白质胶体电泳分析 835
二维聚丙烯醯胺蛋白质电泳 836
以西方氏墨点法分析蛋白质 839
以质谱仪技术鉴定蛋白质 839
蛋白质标定系统 843
使用全长蛋白质做为融合标定物 844
可自我切割的内蛋白子标记 847
以噬菌体展现系统筛选 848
蛋白质交互作用：酵母菌二杂交系统 853
以共同免疫沈淀法判定蛋白质交互作用 857
蛋白质矩阵 860
代谢体学 863